More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2982 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2982  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
323 aa  615  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.018273  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2189  Monosaccharide-transporting ATPase  61.22 
 
 
325 aa  333  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  34.57 
 
 
342 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  40.78 
 
 
317 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  37.38 
 
 
314 aa  152  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.31 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.31 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.31 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.82 
 
 
316 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.31 
 
 
350 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  39.29 
 
 
327 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
310 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 
312 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.02 
 
 
311 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  35.09 
 
 
338 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.09 
 
 
317 aa  142  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  36.02 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.63 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35.04 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  35.4 
 
 
360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 
311 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  33.78 
 
 
337 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 
311 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 
311 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  35.59 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  31.73 
 
 
328 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.94 
 
 
336 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.67 
 
 
311 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.67 
 
 
311 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.4 
 
 
311 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  37.59 
 
 
314 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.74 
 
 
338 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  31.82 
 
 
330 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
309 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  34.95 
 
 
334 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  34.62 
 
 
322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  36.58 
 
 
325 aa  135  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  30.82 
 
 
318 aa  135  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  33.65 
 
 
337 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  33.58 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  34.19 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  37.33 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  36.52 
 
 
334 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 
329 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  31.82 
 
 
330 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  35.92 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  36.84 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  35.67 
 
 
339 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  36.05 
 
 
333 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.12 
 
 
324 aa  132  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  34.35 
 
 
314 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  35.6 
 
 
353 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  34.35 
 
 
329 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  34.58 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  37.37 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3273  putative ABC transporter, permease protein,y4mJ-like protein  32.28 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.715289  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  34.85 
 
 
335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  32.75 
 
 
333 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.49 
 
 
345 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  38.33 
 
 
318 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0371  inner-membrane translocator  34.73 
 
 
338 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  34.58 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.9 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  34.49 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  32.9 
 
 
310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  34.58 
 
 
329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  32.01 
 
 
354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  32.9 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  34.12 
 
 
365 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  34.64 
 
 
347 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.47 
 
 
342 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  31.66 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.47 
 
 
334 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  34.08 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  33.75 
 
 
346 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.47 
 
 
342 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  37.6 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  35.16 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  34.49 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  34.24 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  33.54 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3622  inner-membrane translocator  36.15 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  35.66 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  36.56 
 
 
335 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  34.18 
 
 
345 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2602  inner-membrane translocator  33.64 
 
 
341 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
334 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  30.57 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  33.02 
 
 
345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  37.1 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  33.02 
 
 
345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  31.97 
 
 
324 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  32.88 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>