More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3537 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  298  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1537  putative metalloprotease  46.85 
 
 
145 aa  99  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.576398  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0477  putative metalloprotease  44.64 
 
 
134 aa  96.7  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  46.36 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  46.36 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  46.36 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0449  putative metalloprotease  37.06 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0743  putative metalloprotease  39.26 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  41.09 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  44.07 
 
 
157 aa  88.2  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  43.64 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  45.1 
 
 
411 aa  85.9  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  44.55 
 
 
137 aa  83.6  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  39.66 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  39.36 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  38.79 
 
 
155 aa  77  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  46.67 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  44.83 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  41.32 
 
 
301 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  40.74 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2165  hypothetical protein  34.91 
 
 
122 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  39.1 
 
 
160 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  40.87 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  40.87 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  40.37 
 
 
446 aa  71.6  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  39.13 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  37.59 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  32.81 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  39.82 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1814  hypothetical protein  40.86 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.28628  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  35.97 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  37.72 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  37.93 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  37.27 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  42 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  36.17 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  35.71 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  37.84 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  38.24 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  39.05 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  37.98 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  37.27 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  34.97 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  32.39 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  40.74 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  31.2 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  40.52 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  32.65 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  38.4 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  39.13 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  36.52 
 
 
190 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  36.44 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  40.54 
 
 
169 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  35.85 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  35.78 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  39.13 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  39.13 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  39.13 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  35.83 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  39.13 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.96 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  39.13 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  36.89 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  34.92 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  34.92 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  39.13 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  32.47 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  38.52 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  46.84 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.17 
 
 
437 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  33.33 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  36.7 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.18 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.89 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1670  protein of unknown function UPF0054  33.96 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.89 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02021  metal-dependent hydrolase  38.83 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.89 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  34.56 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.89 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  35.29 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.89 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.18 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  39.09 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  35.71 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  33.58 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  42.7 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  35.2 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0777  hypothetical protein  35.05 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756727  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  37.84 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  33.33 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.7 
 
 
258 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.27 
 
 
274 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  35.71 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.7 
 
 
258 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>