110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2731 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2731  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 394 aa  781    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.39 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  32.5 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.77 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.09 
 
 		 396 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1234  lipopolysaccharide biosynthesis  35.88 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  34.04 
 
 		 401 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0789  lipopolysaccharide biosynthesis  32.47 
 
 		 408 aa  192  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1960  putative transport-related membrane protein  32.97 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954505  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0661  chain length determinant protein  32.97 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0567  chain length determinant protein  32.97 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  31.47 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1888  hypothetical protein  32.14 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.173823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  32.43 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.43 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0643  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.62 
 
 		 398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  29.01 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.2 
 
 		 384 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3061  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.29 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1885  hypothetical protein  28.34 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0889  lipopolysaccharide biosynthesis  25.75 
 
 		 428 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.6181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2625  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 		 403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00623391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 		 463 aa  87  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  24.9 
 
 		 739 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  24.52 
 
 		 739 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.9 
 
 		 739 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  24.52 
 
 		 739 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  25.1 
 
 		 741 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.33 
 
 		 741 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  21.76 
 
 		 747 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  24.14 
 
 		 740 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  24.89 
 
 		 741 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  24.89 
 
 		 741 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.89 
 
 		 741 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  23.75 
 
 		 732 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  25.35 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  25.18 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  23.97 
 
 		 741 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  24.55 
 
 		 736 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  23.33 
 
 		 740 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.97 
 
 		 741 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  22.64 
 
 		 744 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  23.65 
 
 		 802 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  22.22 
 
 		 750 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  25.33 
 
 		 745 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.26 
 
 		 730 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  22.22 
 
 		 741 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  23.08 
 
 		 755 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  20.65 
 
 		 748 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  24.45 
 
 		 745 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.15 
 
 		 726 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  21.46 
 
 		 735 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  24.52 
 
 		 734 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4239  lipopolysaccharide biosynthesis  27.96 
 
 		 517 aa  53.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  24.02 
 
 		 745 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  22.05 
 
 		 753 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  23.6 
 
 		 746 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  25 
 
 		 780 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  22.97 
 
 		 751 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  21.84 
 
 		 781 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.84 
 
 		 780 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  23.83 
 
 		 469 aa  50.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  24.11 
 
 		 746 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  23.32 
 
 		 744 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  28.7 
 
 		 790 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  24.23 
 
 		 740 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  22.87 
 
 		 744 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  24.57 
 
 		 800 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  23.76 
 
 		 746 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3300  WcbD  27.44 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0873208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0522  capsule polysaccharide exporter  27.44 
 
 		 515 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1077  capsule polysaccharide exporter  27.44 
 
 		 515 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.112896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3253  capsule polysaccharide exporter  27.44 
 
 		 515 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.51682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  23.76 
 
 		 746 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3288  capsule polysaccharide exporter  27.44 
 
 		 515 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2184  capsule polysaccharide exporter  27.44 
 
 		 515 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0251  non-specific protein-tyrosine kinase  21.21 
 
 		 751 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  26.55 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  22.03 
 
 		 759 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.47 
 
 		 736 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.28 
 
 		 800 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  22.65 
 
 		 746 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  21.3 
 
 		 784 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4611  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.26 
 
 		 743 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.74 
 
 		 746 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  21.76 
 
 		 784 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 643 aa  47  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.66 
 
 		 806 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  27.01 
 
 		 745 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  20.83 
 
 		 747 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  27.01 
 
 		 747 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  21.24 
 
 		 716 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  27.01 
 
 		 746 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  18.5 
 
 		 753 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  25.36 
 
 		 754 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  24.53 
 
 		 749 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 761 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.66 
 
 		 734 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.66 
 
 		 734 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  19.65 
 
 		 720 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>