83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3288 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3300  WcbD  99.78 
 
 
465 aa  939    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0873208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0522  capsule polysaccharide exporter  100 
 
 
515 aa  1043    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1077  capsule polysaccharide exporter  100 
 
 
515 aa  1043    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.112896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3253  capsule polysaccharide exporter  99.81 
 
 
515 aa  1041    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.51682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3288  capsule polysaccharide exporter  100 
 
 
515 aa  1043    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2184  capsule polysaccharide exporter  100 
 
 
515 aa  1043    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0778  lipopolysaccharide biosynthesis  49.58 
 
 
382 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0295  lipopolysaccharide biosynthesis  49.58 
 
 
382 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1522  lipopolysaccharide biosynthesis protein  48.44 
 
 
385 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2346  lipopolysaccharide biosynthesis  45.68 
 
 
399 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1150  WcbD  49.86 
 
 
388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0184519  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1337  WcbD  46.11 
 
 
388 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3869  capsule polysaccharide export protein-like  44.88 
 
 
380 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0747  WcbD  46.45 
 
 
390 aa  317  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0746  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  42.82 
 
 
365 aa  303  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2961  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  42.28 
 
 
371 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2574  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.28 
 
 
371 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.04 
 
 
369 aa  265  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0662  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein CtrB  34.28 
 
 
391 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.0442626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4014  capsule polysaccharide export-like protein  35.11 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001782  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  31.93 
 
 
381 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2756  capsule polysaccharide export protein-like  32.41 
 
 
400 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.415519  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0722  putative capsule polysaccharide export ABC transporter transmembrane protein  35.85 
 
 
385 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4871  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.44 
 
 
433 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1852  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.45 
 
 
433 aa  156  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2722  capsule polysaccharide export protein-like protein  31.7 
 
 
432 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2583  capsule polysaccharide export protein-like protein  30.33 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000174654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5953  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.75 
 
 
383 aa  153  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2082  capsule polysaccharide export-like protein  33.15 
 
 
407 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2721  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.35 
 
 
411 aa  150  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2087  capsule polysaccharide export protein-like protein  31.74 
 
 
414 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  28.69 
 
 
367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5579  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.13 
 
 
413 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.906457 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  27.62 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4566  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.33 
 
 
448 aa  141  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  28.29 
 
 
372 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  27.95 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  27.95 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0775  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.67 
 
 
414 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0816  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.67 
 
 
414 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.671336  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  28.01 
 
 
371 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3812  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.62 
 
 
416 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.879511  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3904  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 
368 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 
373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5053  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 
436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.522241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1658  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.32 
 
 
413 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3997  hypothetical protein  29.16 
 
 
492 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.740683  normal  0.827295 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4996  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.74 
 
 
443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0773002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4085  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.57 
 
 
448 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160773  normal  0.368018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4453  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.57 
 
 
448 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1304  chain length determinant protein  27.27 
 
 
360 aa  128  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2049  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.7 
 
 
413 aa  123  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0737  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.26 
 
 
414 aa  121  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  25.37 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6013  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.67 
 
 
421 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  25.37 
 
 
382 aa  120  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  25.37 
 
 
382 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4085  capsule polysaccharide export protein-like  27.12 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387523  normal  0.315996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2731  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.15 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  29.23 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0435  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.33 
 
 
413 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00121431 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0654  capsule polysaccharide export protein-like  27.22 
 
 
585 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3817  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.15 
 
 
430 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141093  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1234  capsule polysaccharide export protein-like  28.41 
 
 
579 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195673  normal  0.85548 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3838  capsule polysaccharide export protein  26.85 
 
 
611 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5038  capsule polysaccharide export protein-like  27.14 
 
 
413 aa  113  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2126  capsule polysaccharide export protein-like  28.37 
 
 
652 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0584  capsule polysaccharide export  25.75 
 
 
569 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3238  lipopolysaccharide biosynthesis  24.43 
 
 
483 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4939  lipopolysaccharide biosynthesis  26.3 
 
 
387 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4076  capsule polysaccharide export protein  23.9 
 
 
491 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0711  Capsule polysaccharide export protein  24.51 
 
 
415 aa  100  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0713  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  23.35 
 
 
415 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3819  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 
442 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.670333  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3657  capsule polysaccharide export protein-like  20.28 
 
 
590 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2037  polysaccharide ABC transporter  22.07 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0632  polysaccharide ABC transporter  21.74 
 
 
403 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0379195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  21.31 
 
 
406 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  25.23 
 
 
401 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  29.22 
 
 
409 aa  50.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 
396 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 
422 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>