127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0889 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0889  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
428 aa  864    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.6181  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.59 
 
 
395 aa  193  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  30.99 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.97 
 
 
422 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  28.93 
 
 
406 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.03 
 
 
396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  26.11 
 
 
388 aa  169  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  34.23 
 
 
401 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3061  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 
416 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 
384 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1960  putative transport-related membrane protein  28.99 
 
 
405 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954505  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0661  chain length determinant protein  28.99 
 
 
405 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0567  chain length determinant protein  28.99 
 
 
405 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.94 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  28.46 
 
 
405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0789  lipopolysaccharide biosynthesis  27.49 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1234  lipopolysaccharide biosynthesis  29.7 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2625  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 
403 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00623391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2731  lipopolysaccharide biosynthesis  25.38 
 
 
394 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0643  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 
398 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1888  hypothetical protein  26.81 
 
 
343 aa  87  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.173823  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.09 
 
 
739 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  25.09 
 
 
739 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  24.72 
 
 
739 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  25.09 
 
 
739 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.85 
 
 
730 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  26.56 
 
 
735 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  25.19 
 
 
753 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  24.31 
 
 
736 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1885  hypothetical protein  24.38 
 
 
370 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  22.9 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  22.9 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  21.5 
 
 
372 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  25.37 
 
 
727 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.09 
 
 
800 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  24.31 
 
 
736 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4996  capsule polysaccharide export protein-like protein  22.16 
 
 
443 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0773002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  25.13 
 
 
744 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  26.88 
 
 
734 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  26.07 
 
 
745 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  21.65 
 
 
371 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0394  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  22.38 
 
 
787 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  24.31 
 
 
723 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  25.52 
 
 
747 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  22.94 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  22.94 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  25.57 
 
 
746 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  22.94 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0085  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.94 
 
 
787 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1087  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  22.94 
 
 
787 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1245  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.94 
 
 
787 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1525  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.94 
 
 
787 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2840  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.44 
 
 
787 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.540822  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2689  chain length determinant family protein  22.94 
 
 
787 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0101  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.44 
 
 
760 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  20.23 
 
 
741 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  23.14 
 
 
747 aa  53.1  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4163  lipopolysaccharide biosynthesis  22.93 
 
 
748 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214287  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4203  lipopolysaccharide biosynthesis  22.93 
 
 
748 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  22 
 
 
720 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 
735 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  21.6 
 
 
720 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  21.6 
 
 
720 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  21.6 
 
 
720 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  21.6 
 
 
720 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  23.81 
 
 
721 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  24.76 
 
 
724 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3238  lipopolysaccharide biosynthesis  20.59 
 
 
483 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  21.6 
 
 
720 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  21.6 
 
 
720 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  22.61 
 
 
719 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  19.35 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.7 
 
 
726 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  22.7 
 
 
726 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  22.7 
 
 
726 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.7 
 
 
726 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.7 
 
 
726 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.7 
 
 
726 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.7 
 
 
726 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  24.74 
 
 
726 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.73 
 
 
726 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  21.83 
 
 
719 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  24.45 
 
 
745 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3904  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.34 
 
 
368 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  21.29 
 
 
720 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  21.57 
 
 
784 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  22.9 
 
 
719 aa  50.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  22.9 
 
 
719 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  22.9 
 
 
719 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4085  capsule polysaccharide export protein-like  22.59 
 
 
379 aa  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387523  normal  0.315996 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  20.58 
 
 
499 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.29 
 
 
790 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.45 
 
 
726 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.15 
 
 
806 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  23.55 
 
 
802 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3838  capsule polysaccharide export protein  22.22 
 
 
611 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  21.12 
 
 
720 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.55 
 
 
373 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  19.15 
 
 
746 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>