202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0387 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  100 
 
 
806 aa  1664    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  38.81 
 
 
783 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  40.22 
 
 
969 aa  399  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.05 
 
 
973 aa  389  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  31.03 
 
 
791 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  38.55 
 
 
944 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  36.49 
 
 
951 aa  357  6.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  32.58 
 
 
679 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  30.23 
 
 
770 aa  334  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  35.43 
 
 
695 aa  333  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  33.62 
 
 
661 aa  332  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 
699 aa  331  4e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  33.1 
 
 
679 aa  331  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  32.76 
 
 
679 aa  330  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  32.93 
 
 
679 aa  330  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  32.76 
 
 
679 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  32.76 
 
 
679 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  33.62 
 
 
690 aa  325  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  30.99 
 
 
668 aa  306  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  30.7 
 
 
1024 aa  293  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  32.43 
 
 
840 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  29.51 
 
 
801 aa  283  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 
995 aa  270  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  29.22 
 
 
777 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  33.03 
 
 
779 aa  265  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  29.86 
 
 
828 aa  257  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  32.66 
 
 
760 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  27.57 
 
 
779 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  29.64 
 
 
768 aa  249  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 
974 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  29.92 
 
 
836 aa  248  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  28.38 
 
 
746 aa  246  9e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  29.65 
 
 
792 aa  245  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  27.65 
 
 
752 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  29.25 
 
 
779 aa  244  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  30.92 
 
 
845 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  29.26 
 
 
743 aa  236  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  30.66 
 
 
765 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  29.39 
 
 
821 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  26.87 
 
 
785 aa  233  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  31.17 
 
 
765 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  27.48 
 
 
839 aa  228  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  27.62 
 
 
803 aa  227  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  27.04 
 
 
794 aa  221  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  25.87 
 
 
776 aa  220  7e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  27.24 
 
 
836 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  27.4 
 
 
797 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  26.28 
 
 
795 aa  213  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  26.28 
 
 
795 aa  213  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.66 
 
 
787 aa  212  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  28.24 
 
 
815 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  29.23 
 
 
825 aa  209  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  28.08 
 
 
806 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  27.6 
 
 
813 aa  207  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.5 
 
 
799 aa  207  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  27.11 
 
 
775 aa  207  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.09 
 
 
788 aa  205  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.97 
 
 
791 aa  204  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.09 
 
 
788 aa  204  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.67 
 
 
821 aa  203  9e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.32 
 
 
788 aa  203  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  26.62 
 
 
757 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  26.8 
 
 
764 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  27.01 
 
 
803 aa  201  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  26.62 
 
 
821 aa  200  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  26.86 
 
 
685 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  26.62 
 
 
764 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  27.76 
 
 
790 aa  199  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  27.33 
 
 
803 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  25.45 
 
 
772 aa  194  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  27.81 
 
 
803 aa  194  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  27.57 
 
 
795 aa  194  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  28 
 
 
816 aa  194  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  27.44 
 
 
794 aa  193  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 
695 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  26.39 
 
 
779 aa  191  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  25.76 
 
 
687 aa  191  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  26.72 
 
 
791 aa  191  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  26.72 
 
 
791 aa  190  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  27.43 
 
 
806 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  25.97 
 
 
911 aa  187  5e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 
806 aa  187  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  25.89 
 
 
952 aa  187  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  26.2 
 
 
772 aa  187  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  26.72 
 
 
789 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  26.42 
 
 
806 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  27.08 
 
 
806 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  26.44 
 
 
798 aa  185  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  27.56 
 
 
771 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  25.18 
 
 
760 aa  185  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  24.22 
 
 
770 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  25.91 
 
 
763 aa  184  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  28.71 
 
 
828 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 
806 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 
806 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  25.66 
 
 
823 aa  182  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  26.19 
 
 
775 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 
799 aa  182  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 
799 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  26.06 
 
 
772 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>