42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3159 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  100 
 
 		 200 aa  381  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  84.46 
 
 		 204 aa  241  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  36.69 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  41.48 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  38.24 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  36.81 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  31.65 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  34.53 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  26.64 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  35.77 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  36.11 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  34.31 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  35.17 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  38.64 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  39.13 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  30.88 
 
 		 416 aa  58.2  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  42.16 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  38.21 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  42.71 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  35.11 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  39.13 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  35.22 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  46.67 
 
 		 361 aa  52  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0479  type II secretion system protein  40.48 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00167039  hitchhiker  0.0082018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  37.1 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  26.28 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  33.13 
 
 		 448 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  46.38 
 
 		 519 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  32.64 
 
 		 307 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  34.31 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 331 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  36.63 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  53.49 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  28.37 
 
 		 303 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  60.71 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  60.71 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  60.71 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 306 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  32.12 
 
 		 318 aa  42  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 306 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>