81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2874 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2874  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 67 aa  130  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  46.55 
 
 		 652 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  40.98 
 
 		 383 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  37.29 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  49.06 
 
 		 266 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  40.38 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4233  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  40.38 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 72 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0746  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.46 
 
 		 306 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 84 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  44 
 
 		 642 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 68 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  53.33 
 
 		 508 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2064  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 806 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2453  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2151  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.194811  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3755  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 219 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  39.58 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699676  decreased coverage  0.000887341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 199 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 282 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2112  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35.71 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280682 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40.38 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2388  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35.71 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  42 
 
 		 251 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  46.77 
 
 		 509 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0259  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000494587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  38.46 
 
 		 196 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 108 aa  40  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  35.94 
 
 		 210 aa  40  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 108 aa  40  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>