More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2495 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2773  glutamyl-tRNA reductase  88.34 
 
 		 440 aa  739    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2495  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 441 aa  874    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15240  glutamyl-tRNA reductase  55.3 
 
 		 450 aa  418  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.574725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36020  glutamyl-tRNA reductase  39.73 
 
 		 502 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.799704  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3434  glutamyl-tRNA reductase  44.86 
 
 		 425 aa  256  6e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627515  hitchhiker  0.00368913 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2484  Glutamyl-tRNA reductase  40.93 
 
 		 474 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.682056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1549  glutamyl-tRNA reductase  39.39 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.214578  normal  0.338338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4009  glutamyl-tRNA reductase  39.69 
 
 		 441 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26740  glutamyl-tRNA reductase  34.91 
 
 		 500 aa  219  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3248  Glutamyl-tRNA reductase  46.95 
 
 		 540 aa  204  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.696727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  34.65 
 
 		 440 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  34.53 
 
 		 440 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  31.35 
 
 		 443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  33.01 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  30.69 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  33.09 
 
 		 473 aa  156  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  30.28 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  29.41 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  31.28 
 
 		 473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  31.7 
 
 		 448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  33.89 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.23 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  34.41 
 
 		 430 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  32.18 
 
 		 455 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 468 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  32.99 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  29.76 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  32.03 
 
 		 476 aa  136  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  31.47 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  29.3 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  29.91 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  31.54 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  31.54 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  31.54 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  30.71 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  27.29 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  29.16 
 
 		 434 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  30.15 
 
 		 436 aa  133  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  29.95 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  29.7 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  27.94 
 
 		 464 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  27.59 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  29.46 
 
 		 425 aa  129  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  30.32 
 
 		 440 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  29.07 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  31.15 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  25.76 
 
 		 443 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  33.71 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  30.52 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  31.15 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  27.32 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  28.42 
 
 		 443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  27.58 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  25.69 
 
 		 444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  27.92 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  30.91 
 
 		 446 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  28.24 
 
 		 451 aa  120  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  27.49 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  22.51 
 
 		 441 aa  119  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  27.95 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  26.13 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  29.52 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  28.3 
 
 		 446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  27.84 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  29.27 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  25.69 
 
 		 416 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  29.27 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  28.09 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  28.09 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  28.09 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  28.09 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  30.21 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  28.4 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  27.94 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  26.53 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  27.71 
 
 		 432 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  26.08 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  26.53 
 
 		 424 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  28.47 
 
 		 432 aa  113  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  27.25 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  28.75 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  25.44 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  28.75 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  28.75 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  28.75 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  28.75 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  27.79 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  28.75 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  27.6 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  28.75 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  28.77 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  26.26 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  26.32 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  25.65 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  27.25 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>