263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1903 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
312 aa  617  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  67.06 
 
 
261 aa  318  7e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62.5 
 
 
268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  60 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  60.15 
 
 
301 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  59.93 
 
 
294 aa  301  9e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  63.04 
 
 
271 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  65.74 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.79 
 
 
284 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  61.54 
 
 
235 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62.61 
 
 
228 aa  275  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  62.83 
 
 
233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.6 
 
 
284 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  61.97 
 
 
299 aa  264  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  58.3 
 
 
240 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  60.35 
 
 
244 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.92 
 
 
282 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  60.94 
 
 
230 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  57.87 
 
 
266 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62.5 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  55.24 
 
 
299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  56.98 
 
 
291 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  59.13 
 
 
276 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.02 
 
 
226 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  55.26 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.96 
 
 
226 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  60.45 
 
 
281 aa  236  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.42 
 
 
226 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  59.03 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  59.03 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  59.03 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  55.7 
 
 
221 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.21 
 
 
236 aa  215  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.02 
 
 
228 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50.66 
 
 
221 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.92 
 
 
217 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.98 
 
 
186 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.05 
 
 
219 aa  176  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.79 
 
 
210 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.48 
 
 
206 aa  160  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.56 
 
 
215 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.79 
 
 
217 aa  158  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.87 
 
 
220 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  41.55 
 
 
224 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.65 
 
 
214 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.28 
 
 
231 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.22 
 
 
232 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.68 
 
 
225 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.86 
 
 
224 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.01 
 
 
220 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.44 
 
 
200 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  41.47 
 
 
207 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.47 
 
 
226 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.79 
 
 
236 aa  142  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.18 
 
 
225 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.01 
 
 
242 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.1 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.66 
 
 
228 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.95 
 
 
238 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.66 
 
 
233 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.62 
 
 
212 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  41.59 
 
 
218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.93 
 
 
214 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  39.63 
 
 
229 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.28 
 
 
232 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.5 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.94 
 
 
211 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  36.73 
 
 
228 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.31 
 
 
215 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.09 
 
 
223 aa  122  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.09 
 
 
223 aa  122  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.5 
 
 
216 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.39 
 
 
220 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.84 
 
 
192 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.1 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.46 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.33 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.15 
 
 
195 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4460  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.48 
 
 
207 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.18 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.55 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  34.76 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.17 
 
 
200 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.25 
 
 
294 aa  65.1  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.76 
 
 
210 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0183  Uracil-DNA glycosylase superfamily  30.61 
 
 
210 aa  63.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.589955  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1768  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.06 
 
 
194 aa  62.8  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
196 aa  62.8  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4246  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.9 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.16 
 
 
217 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4616  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.9 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4766  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.9 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.35 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.41 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0356  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.22 
 
 
225 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.606658  normal  0.0957243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.35 
 
 
264 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.88 
 
 
210 aa  60.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0231  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  22.78 
 
 
252 aa  60.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0104568  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.86 
 
 
199 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>