59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2755 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  39.38 
 
 		 913 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  38.21 
 
 		 1042 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  100 
 
 		 964 aa  1996    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  40.25 
 
 		 917 aa  663    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  42.39 
 
 		 908 aa  746    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  38.53 
 
 		 955 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  38.96 
 
 		 913 aa  635  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  37.27 
 
 		 938 aa  624  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  37.94 
 
 		 949 aa  621  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  38.83 
 
 		 955 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  38.25 
 
 		 949 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  38.49 
 
 		 969 aa  609  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  38.3 
 
 		 963 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  38.56 
 
 		 962 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  38.76 
 
 		 962 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  37.09 
 
 		 941 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  37.01 
 
 		 956 aa  601  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  38.29 
 
 		 960 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  38.56 
 
 		 962 aa  602  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  37.67 
 
 		 948 aa  602  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  38.18 
 
 		 973 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  38.33 
 
 		 978 aa  600  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  37.49 
 
 		 983 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  37.21 
 
 		 954 aa  596  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  37.8 
 
 		 980 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  37.99 
 
 		 963 aa  598  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  38.19 
 
 		 1002 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  36.89 
 
 		 954 aa  595  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  37.1 
 
 		 952 aa  595  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  38.18 
 
 		 960 aa  595  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  38 
 
 		 889 aa  572  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  28.24 
 
 		 916 aa  338  3.9999999999999995e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  28.24 
 
 		 916 aa  338  3.9999999999999995e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  34.1 
 
 		 659 aa  335  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  25.68 
 
 		 924 aa  316  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  50.44 
 
 		 240 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.83 
 
 		 868 aa  61.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  26.79 
 
 		 874 aa  57  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  24.57 
 
 		 847 aa  55.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  26.02 
 
 		 803 aa  53.9  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  24.62 
 
 		 815 aa  54.3  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  24.35 
 
 		 815 aa  51.6  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  24.8 
 
 		 816 aa  51.2  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.18 
 
 		 805 aa  49.7  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.61 
 
 		 819 aa  49.7  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  27.71 
 
 		 815 aa  47.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  20.09 
 
 		 801 aa  46.6  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  23.08 
 
 		 800 aa  47  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  23.08 
 
 		 800 aa  47  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  27.51 
 
 		 864 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.59 
 
 		 804 aa  46.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  26.92 
 
 		 864 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  27.5 
 
 		 822 aa  45.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  28.67 
 
 		 818 aa  44.7  0.008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.12 
 
 		 843 aa  44.7  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  23.23 
 
 		 788 aa  44.7  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  20.61 
 
 		 819 aa  44.3  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  24.84 
 
 		 855 aa  44.3  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  24.84 
 
 		 855 aa  44.7  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>