55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1362 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  100 
 
 
425 aa  847    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  44.67 
 
 
431 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  34.17 
 
 
492 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  34.27 
 
 
436 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  28.25 
 
 
461 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  31.53 
 
 
458 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  23.68 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  23.72 
 
 
532 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  24.72 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  24.74 
 
 
781 aa  67  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  26.1 
 
 
475 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  22.09 
 
 
467 aa  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  24.42 
 
 
471 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  24.52 
 
 
504 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  22.98 
 
 
754 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  26.76 
 
 
457 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  28.74 
 
 
471 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  21.6 
 
 
474 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.51 
 
 
540 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  28.37 
 
 
452 aa  59.7  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  26.76 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  24.73 
 
 
470 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.5 
 
 
496 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  24.04 
 
 
459 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  24.65 
 
 
467 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  22.81 
 
 
461 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  29.07 
 
 
471 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  22.91 
 
 
501 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  21.63 
 
 
393 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  21.69 
 
 
737 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  26.84 
 
 
468 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  27.78 
 
 
498 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  28.18 
 
 
487 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  26.92 
 
 
480 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  22.01 
 
 
425 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  25.82 
 
 
494 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  25.48 
 
 
464 aa  47  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 
870 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  23.27 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  31.76 
 
 
537 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  25 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  27.17 
 
 
595 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  26.29 
 
 
465 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  29.41 
 
 
459 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  23.75 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  22.54 
 
 
404 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  22.54 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  22.54 
 
 
404 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  21.67 
 
 
773 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  28.37 
 
 
671 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  27.17 
 
 
444 aa  43.5  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0733  O-antigen polymerase  25.14 
 
 
485 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2080  O-antigen polymerase  23.91 
 
 
411 aa  43.5  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.473077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  24.16 
 
 
437 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  23.03 
 
 
404 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>