52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0942 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  100 
 
 
147 aa  297  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  44.92 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  40.16 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  39.34 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  37.7 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  35.9 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  37.61 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  37.4 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  38.33 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  34.96 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  34.96 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  34.15 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  33.61 
 
 
143 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  39.66 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  32.48 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  33.9 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  30.89 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  31.62 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  27.64 
 
 
146 aa  52  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  33.9 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  27.97 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  25.83 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  32.48 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  28.93 
 
 
141 aa  47.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  28.81 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  37.4 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  29.31 
 
 
142 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  31.4 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  33.61 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  29.66 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  33.61 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  29.66 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  28.23 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  31.01 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0506  hypothetical protein  33.8 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0731238  normal  0.493986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3152  hypothetical protein  33.78 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0152929  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  26.67 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  30.65 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  42.59 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  30.65 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  35.59 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  31.09 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  30.51 
 
 
165 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  30.51 
 
 
165 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  29.66 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  29.66 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  27.87 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  30.51 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  25.41 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  25.41 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>