202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0724 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  100 
 
 
353 aa  706    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  36.89 
 
 
351 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.76 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  35.82 
 
 
347 aa  236  6e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  35.45 
 
 
347 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  34.87 
 
 
347 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 
345 aa  226  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.5 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  35.19 
 
 
361 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.22 
 
 
353 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  34.31 
 
 
351 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.82 
 
 
360 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  36.56 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  40.07 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  32.93 
 
 
349 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  32.93 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  33.43 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  33.43 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  33.43 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.9 
 
 
383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  33.53 
 
 
349 aa  195  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  33.53 
 
 
349 aa  195  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  32.93 
 
 
349 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  32.93 
 
 
349 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  33.23 
 
 
349 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  33.23 
 
 
349 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  37.25 
 
 
365 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  35.79 
 
 
336 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  32.93 
 
 
349 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  32.93 
 
 
349 aa  193  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  32.93 
 
 
349 aa  193  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 
353 aa  192  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  32.93 
 
 
349 aa  192  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.83 
 
 
336 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 
355 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.4 
 
 
331 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2457  malate/L-lactate dehydrogenase  39.59 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.35 
 
 
338 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.79 
 
 
334 aa  182  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  34.31 
 
 
362 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  36.25 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.85 
 
 
329 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.95 
 
 
364 aa  178  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  35.91 
 
 
337 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.99 
 
 
372 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  36.14 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  32.48 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.87 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.23 
 
 
355 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.03 
 
 
333 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.5 
 
 
356 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  30.97 
 
 
369 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.57 
 
 
359 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  36.66 
 
 
352 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.24 
 
 
364 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  35.44 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  33.92 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  29.51 
 
 
376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.8 
 
 
357 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  36.59 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  36.79 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  36.39 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.44 
 
 
349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.44 
 
 
349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  35.79 
 
 
336 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  35.82 
 
 
332 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  35.71 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  34.83 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  33.77 
 
 
349 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  34.01 
 
 
349 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  33.63 
 
 
340 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  35.93 
 
 
341 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  34.23 
 
 
344 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.56 
 
 
361 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
340 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  33.05 
 
 
350 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3548  malate/L-lactate dehydrogenase  34 
 
 
358 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0039901  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  39.77 
 
 
329 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.97 
 
 
732 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  40 
 
 
350 aa  159  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  32.93 
 
 
340 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  31.6 
 
 
344 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  32.93 
 
 
340 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  32.93 
 
 
340 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  32.44 
 
 
334 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  31.59 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 
350 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.17 
 
 
350 aa  156  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  33.33 
 
 
344 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
344 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.43 
 
 
344 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  32.39 
 
 
348 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  33.03 
 
 
344 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  33.03 
 
 
344 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  33.03 
 
 
344 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  28.33 
 
 
358 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  34.08 
 
 
346 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.87 
 
 
345 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  32.29 
 
 
337 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>