More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_14501 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  100 
 
 
586 aa  1138    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  34.84 
 
 
586 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  30.23 
 
 
613 aa  296  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  33.51 
 
 
599 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  31.46 
 
 
571 aa  293  7e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  34.64 
 
 
576 aa  280  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  29.29 
 
 
600 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  29.69 
 
 
611 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  29.93 
 
 
600 aa  260  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  30.55 
 
 
600 aa  259  8e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  32.42 
 
 
552 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  27.35 
 
 
625 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  27.93 
 
 
594 aa  240  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  27.44 
 
 
605 aa  238  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  29.37 
 
 
599 aa  237  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  28.23 
 
 
603 aa  233  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  27.41 
 
 
628 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  29.07 
 
 
599 aa  226  7e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  28.46 
 
 
568 aa  220  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  31.99 
 
 
583 aa  220  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.79 
 
 
564 aa  217  4e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  28.5 
 
 
611 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  28.33 
 
 
611 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  31.11 
 
 
596 aa  212  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  31.11 
 
 
586 aa  212  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  31.99 
 
 
596 aa  210  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  29.73 
 
 
626 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  32.19 
 
 
610 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.04 
 
 
564 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  30.43 
 
 
585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  32.02 
 
 
610 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.99 
 
 
564 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  27.5 
 
 
564 aa  197  3e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  30.68 
 
 
583 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  26.59 
 
 
603 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  27 
 
 
606 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  27.88 
 
 
614 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  25.59 
 
 
607 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  27.05 
 
 
638 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  28.68 
 
 
610 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  29.96 
 
 
578 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  33.9 
 
 
601 aa  180  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  26.26 
 
 
612 aa  180  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.9 
 
 
601 aa  179  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  45.45 
 
 
578 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  42.27 
 
 
575 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  39.3 
 
 
582 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  43.38 
 
 
550 aa  174  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  38.22 
 
 
585 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  38.57 
 
 
586 aa  173  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  37.97 
 
 
583 aa  173  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  39.3 
 
 
593 aa  173  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  26.46 
 
 
613 aa  172  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  38.6 
 
 
597 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  30.77 
 
 
651 aa  171  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 
604 aa  170  7e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  38.94 
 
 
636 aa  170  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  37.07 
 
 
730 aa  170  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  27.33 
 
 
610 aa  170  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  40.68 
 
 
606 aa  170  8e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  28.54 
 
 
625 aa  169  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  40.43 
 
 
577 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.09 
 
 
634 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  40.43 
 
 
577 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  37.24 
 
 
930 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  38.53 
 
 
746 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.71 
 
 
641 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  31.11 
 
 
585 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  39.56 
 
 
580 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  36.95 
 
 
574 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  41.48 
 
 
597 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  30.33 
 
 
590 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 
630 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40 
 
 
586 aa  167  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.71 
 
 
639 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  34.55 
 
 
718 aa  166  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.01 
 
 
577 aa  166  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  35.83 
 
 
742 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  28.84 
 
 
575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  35.58 
 
 
712 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  40 
 
 
598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
764 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  29.56 
 
 
601 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.92 
 
 
1000 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  35.58 
 
 
712 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  34.89 
 
 
1040 aa  165  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  41.05 
 
 
594 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.78 
 
 
579 aa  165  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  35.58 
 
 
712 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  29.56 
 
 
601 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0616  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  42.34 
 
 
591 aa  164  4.0000000000000004e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.146496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  38.82 
 
 
569 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  40.99 
 
 
575 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  42.34 
 
 
546 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  36.7 
 
 
587 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  34.56 
 
 
676 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 
619 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  28.42 
 
 
610 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  40.87 
 
 
699 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  30.99 
 
 
590 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>