99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Leu-4 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0582  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 83 bp  75.8  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0911  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1288  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0063  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14570  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60280  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0013  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0408  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0047  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R36  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1015  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t18  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0030  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.931427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0033  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0025  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.680861  decreased coverage  0.000577389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0036  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0044  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0038  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.504374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0097  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00291097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0100  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00215722  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0102  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00398757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0104  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00197165  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0039  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000720687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>