58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_R0025 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.680861  decreased coverage  0.000577389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0015  tRNA-Leu  95.51 
 
 		 93 bp  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0041  tRNA-Leu  90.54 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0015  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 92 bp  69.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0025  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 92 bp  69.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0021  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 92 bp  69.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04001  tRNA-Leu  95 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000386269  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0030  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0003  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0039  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000720687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0016  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0011  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000652863  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0014  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000912382  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0048  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0036  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.773561  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0018  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.864301 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0031  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.372245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0067  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50283  hitchhiker  0.00109765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0051  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t094  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0031  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0128  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000373913 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0028  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0022  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu02  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0043  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000409272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>