114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2080 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
170 aa  334  3.9999999999999995e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  55.56 
 
 
164 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  49.69 
 
 
169 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  49.37 
 
 
165 aa  158  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  51.25 
 
 
161 aa  157  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  52.98 
 
 
168 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  50 
 
 
196 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  51.66 
 
 
174 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  48.12 
 
 
159 aa  137  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  46.01 
 
 
177 aa  131  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  47.53 
 
 
164 aa  130  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  47.8 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  43.9 
 
 
165 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  47.2 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  38.64 
 
 
186 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  44.64 
 
 
177 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  46.01 
 
 
165 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  46.01 
 
 
165 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  46.01 
 
 
165 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  57.89 
 
 
160 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  39.18 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  48.7 
 
 
181 aa  107  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  42.42 
 
 
164 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  38.01 
 
 
172 aa  104  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  39.46 
 
 
167 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  36.14 
 
 
174 aa  92  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  38.83 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  35.67 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  30.77 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
550 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  37.65 
 
 
153 aa  52  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  29.59 
 
 
163 aa  51.6  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  25.52 
 
 
207 aa  50.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  34.94 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  24.53 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  29.89 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  29.89 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  23.12 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  24.53 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  28.68 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  29.37 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  36.9 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
174 aa  48.5  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  33.09 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  19.44 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  23.9 
 
 
158 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  23.9 
 
 
158 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  36.25 
 
 
170 aa  48.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  24.52 
 
 
158 aa  47.8  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  26.67 
 
 
191 aa  47.8  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  23.9 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  23.9 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  23.27 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  29.56 
 
 
242 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  35.8 
 
 
180 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  23.27 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  34.34 
 
 
162 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  25.81 
 
 
554 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  42.62 
 
 
555 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  41.67 
 
 
498 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  40 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  29.9 
 
 
512 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  29.23 
 
 
203 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  19.64 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  34.57 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  23.27 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  37.68 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  32.22 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  26.35 
 
 
195 aa  45.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  32.74 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  23.85 
 
 
472 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  27.61 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  34.57 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  27.4 
 
 
491 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  30.15 
 
 
521 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 
228 aa  44.7  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  34.52 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  32.12 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  31.88 
 
 
167 aa  44.7  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21820  hypothetical protein  35.37 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  32.53 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  38.46 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  31.03 
 
 
491 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  34.41 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  39.62 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  38.46 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  28.05 
 
 
486 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  30.49 
 
 
558 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  29.76 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  36.47 
 
 
555 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  35.82 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1687  hypothetical protein  21.28 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  27.63 
 
 
551 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  37.5 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  34.41 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  41.82 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  34.41 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  23.72 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  25.66 
 
 
203 aa  42  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>