More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0155 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
212 aa  417  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  61.27 
 
 
215 aa  217  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  47.47 
 
 
237 aa  169  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  50.5 
 
 
198 aa  164  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  45.67 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  42.27 
 
 
236 aa  147  9e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  43.72 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  46.73 
 
 
223 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  45.5 
 
 
194 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  47.5 
 
 
194 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  45 
 
 
193 aa  141  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  44.61 
 
 
193 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  46.11 
 
 
193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  46.34 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  44 
 
 
195 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  44.12 
 
 
193 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  41.71 
 
 
189 aa  127  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  41.5 
 
 
200 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  41.09 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  43.54 
 
 
240 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  42.79 
 
 
203 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  38.31 
 
 
210 aa  121  7e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  41.88 
 
 
206 aa  121  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  39.9 
 
 
190 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  37.76 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  36.41 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  35.64 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  40.2 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  40.2 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  40.2 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 
202 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 
244 aa  106  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  39.39 
 
 
228 aa  105  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  36.22 
 
 
227 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 
238 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  44.52 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  39.32 
 
 
195 aa  95.9  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 
234 aa  95.5  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.16 
 
 
442 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30 
 
 
442 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  33.01 
 
 
239 aa  89  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  33.33 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.12 
 
 
212 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
212 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.65 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.05 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  32.51 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 
452 aa  79.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 
389 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.77 
 
 
442 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  31.05 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.67 
 
 
443 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
445 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.79 
 
 
547 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>