157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0309 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  705    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  37.25 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  32.29 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  32.49 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  33.02 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  30.94 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  30.99 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0145  hypothetical protein  30.6 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  31.98 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2601  hypothetical protein  35.48 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  36.42 
 
 		 359 aa  92.8  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0706  hypothetical protein  32.19 
 
 		 373 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  32.89 
 
 		 395 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  31.76 
 
 		 338 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  33.11 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  24.65 
 
 		 708 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  30.2 
 
 		 659 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.26 
 
 		 720 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  30.39 
 
 		 733 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  29.83 
 
 		 733 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  34.75 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  30.38 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.22 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  34.75 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.33 
 
 		 746 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  24.24 
 
 		 733 aa  57.4  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  27.92 
 
 		 700 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1742  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1809  hypothetical protein  29.32 
 
 		 176 aa  55.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.5 
 
 		 708 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  29.8 
 
 		 704 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  29.73 
 
 		 702 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.33 
 
 		 738 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  27.43 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  29.53 
 
 		 188 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  24.4 
 
 		 725 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  22.04 
 
 		 717 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  29.63 
 
 		 188 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.22 
 
 		 727 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.33 
 
 		 738 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.22 
 
 		 727 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.61 
 
 		 727 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.22 
 
 		 727 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.73 
 
 		 724 aa  53.1  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.07 
 
 		 746 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  28.93 
 
 		 737 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  29.41 
 
 		 740 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.93 
 
 		 727 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  29.1 
 
 		 151 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  27.27 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1207  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25.73 
 
 		 688 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00411304  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  29.46 
 
 		 189 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  29.1 
 
 		 189 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2925  membrane protein-like protein  31.29 
 
 		 749 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119201  hitchhiker  0.0000166782 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  30 
 
 		 653 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.07 
 
 		 722 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  22.7 
 
 		 717 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  28.36 
 
 		 188 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  28.36 
 
 		 188 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0235  hypothetical protein  29.17 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  25 
 
 		 727 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.1 
 
 		 727 aa  50.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  26.2 
 
 		 700 aa  50.1  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  29.14 
 
 		 698 aa  50.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3344  hypothetical protein  27.46 
 
 		 632 aa  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  27.61 
 
 		 188 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0100  membrane protein-like protein  27.86 
 
 		 715 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  31.37 
 
 		 736 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1226  hypothetical protein  22.87 
 
 		 636 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000692495  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.2 
 
 		 700 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0085  membrane protein-like protein  27.88 
 
 		 718 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  26.49 
 
 		 721 aa  48.5  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0094  membrane protein-like protein  27.88 
 
 		 718 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  30.28 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.37 
 
 		 739 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0075  membrane protein-like protein  27.88 
 
 		 718 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986959  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  30.28 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  31.74 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.6 
 
 		 697 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  26.01 
 
 		 732 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  27.15 
 
 		 697 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  28.86 
 
 		 744 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6403  cyclic nucleotide-binding protein  27.7 
 
 		 692 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  29.08 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3199  hypothetical protein  24.28 
 
 		 700 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000232699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  29.08 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  31.36 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  29.08 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  29.08 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  29.08 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  25.88 
 
 		 732 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  26.56 
 
 		 725 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  27.21 
 
 		 238 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.22 
 
 		 763 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2051  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.19 
 
 		 752 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4804  membrane protein-like protein  29.17 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.68 
 
 		 719 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.03 
 
 		 700 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>