115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2925 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2925  membrane protein-like protein  100 
 
 		 749 aa  1439    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119201  hitchhiker  0.0000166782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0085  membrane protein-like protein  41.16 
 
 		 718 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0094  membrane protein-like protein  41.16 
 
 		 718 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0075  membrane protein-like protein  41.16 
 
 		 718 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986959  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0100  membrane protein-like protein  42.44 
 
 		 715 aa  348  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0746  membrane protein-like protein  41.92 
 
 		 712 aa  328  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0258  hypothetical protein  36.58 
 
 		 829 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4661  hypothetical protein  37.07 
 
 		 776 aa  297  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4074  membrane protein-like  35.23 
 
 		 889 aa  238  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  45.42 
 
 		 745 aa  208  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7033  hypothetical protein  51.95 
 
 		 874 aa  147  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3554  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.03 
 
 		 728 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0186862  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  31.84 
 
 		 727 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  20.49 
 
 		 740 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  32.65 
 
 		 359 aa  63.9  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0564  hypothetical protein  23.88 
 
 		 653 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  31.41 
 
 		 720 aa  62.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  30.07 
 
 		 731 aa  62  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.96 
 
 		 746 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  30.77 
 
 		 717 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  30.77 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  30.77 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  30.77 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  30.77 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  30.77 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  30.77 
 
 		 717 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  30.77 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.72 
 
 		 727 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  24.14 
 
 		 717 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  24.14 
 
 		 717 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  24.14 
 
 		 717 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  24.14 
 
 		 717 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  24.14 
 
 		 717 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.72 
 
 		 727 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  28.76 
 
 		 721 aa  60.1  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.43 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.54 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  26.46 
 
 		 700 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  22.28 
 
 		 695 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  22.1 
 
 		 695 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.28 
 
 		 695 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.28 
 
 		 695 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.22 
 
 		 695 aa  56.6  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  30.86 
 
 		 631 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.1 
 
 		 695 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  24.22 
 
 		 733 aa  55.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  28.21 
 
 		 712 aa  55.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  28.21 
 
 		 712 aa  54.7  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  28.21 
 
 		 712 aa  54.7  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.89 
 
 		 720 aa  54.7  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  26.73 
 
 		 360 aa  54.3  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  22.51 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  28.21 
 
 		 347 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  28.21 
 
 		 720 aa  53.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.98 
 
 		 719 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  25.65 
 
 		 734 aa  52.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  26.92 
 
 		 711 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  25.15 
 
 		 721 aa  52  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  26.28 
 
 		 711 aa  52  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  26.92 
 
 		 711 aa  52  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.82 
 
 		 727 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.87 
 
 		 706 aa  51.2  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  30.57 
 
 		 737 aa  51.2  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.82 
 
 		 727 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  25.62 
 
 		 727 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.82 
 
 		 727 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.18 
 
 		 727 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  20.99 
 
 		 764 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  20.99 
 
 		 764 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  23.12 
 
 		 725 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.99 
 
 		 764 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  25.13 
 
 		 700 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.13 
 
 		 696 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  26.7 
 
 		 732 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  28.4 
 
 		 732 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.21 
 
 		 756 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.87 
 
 		 706 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.13 
 
 		 696 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.13 
 
 		 696 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.87 
 
 		 706 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.13 
 
 		 696 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.5 
 
 		 696 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.13 
 
 		 696 aa  49.3  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.13 
 
 		 696 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  25.13 
 
 		 700 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.52 
 
 		 708 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  19.89 
 
 		 763 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1207  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  28.95 
 
 		 688 aa  48.9  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00411304  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  24 
 
 		 717 aa  48.9  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3629  membrane protein  27.41 
 
 		 647 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.89 
 
 		 763 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  25.28 
 
 		 395 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  28.33 
 
 		 372 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  28.33 
 
 		 372 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  28.33 
 
 		 372 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  23.53 
 
 		 338 aa  48.5  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.11 
 
 		 763 aa  48.9  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  28 
 
 		 364 aa  48.5  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  28.02 
 
 		 374 aa  47.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.35 
 
 		 696 aa  47.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>