99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0258 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0258  hypothetical protein  100 
 
 		 829 aa  1593    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7033  hypothetical protein  52.24 
 
 		 874 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4074  membrane protein-like  57.41 
 
 		 889 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  41.73 
 
 		 745 aa  436  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0075  membrane protein-like protein  34.93 
 
 		 718 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986959  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0094  membrane protein-like protein  34.93 
 
 		 718 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0085  membrane protein-like protein  34.93 
 
 		 718 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4661  hypothetical protein  33.51 
 
 		 776 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0100  membrane protein-like protein  33.9 
 
 		 715 aa  238  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0746  membrane protein-like protein  35.23 
 
 		 712 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2925  membrane protein-like protein  39.84 
 
 		 749 aa  188  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119201  hitchhiker  0.0000166782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  28.25 
 
 		 727 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  29.06 
 
 		 721 aa  71.2  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3554  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  34.54 
 
 		 728 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0186862  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  28.12 
 
 		 731 aa  68.9  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.32 
 
 		 746 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0564  hypothetical protein  21.89 
 
 		 653 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.21 
 
 		 719 aa  61.6  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  27.35 
 
 		 734 aa  60.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  26.13 
 
 		 717 aa  60.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  25 
 
 		 725 aa  60.1  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  32.35 
 
 		 727 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  32.35 
 
 		 727 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.86 
 
 		 695 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.86 
 
 		 695 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  25.86 
 
 		 695 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  25.86 
 
 		 695 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.43 
 
 		 695 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.56 
 
 		 746 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  22.22 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  26.98 
 
 		 720 aa  58.9  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  27.13 
 
 		 720 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  24.35 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.13 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  26.46 
 
 		 717 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  26.46 
 
 		 717 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  26.6 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  25.79 
 
 		 717 aa  57.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  26.6 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  26.6 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  26.6 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  22.22 
 
 		 712 aa  57.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  26.6 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  24.02 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  22.22 
 
 		 712 aa  57.4  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.24 
 
 		 720 aa  56.6  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  24.66 
 
 		 733 aa  56.2  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  28.7 
 
 		 737 aa  56.2  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  32 
 
 		 756 aa  55.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  25.21 
 
 		 732 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  26.49 
 
 		 720 aa  55.1  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  22.76 
 
 		 338 aa  54.3  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  25.83 
 
 		 717 aa  54.3  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.33 
 
 		 727 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  25.83 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  25.83 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  25.83 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  25.83 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.33 
 
 		 727 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.33 
 
 		 727 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.73 
 
 		 727 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  30.34 
 
 		 431 aa  53.5  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.98 
 
 		 695 aa  52.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  25.33 
 
 		 732 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1080  FlhB domain-containing protein  21.15 
 
 		 649 aa  52.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.990199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.37 
 
 		 706 aa  52  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.32 
 
 		 696 aa  52  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  20.98 
 
 		 740 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.87 
 
 		 696 aa  52  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.32 
 
 		 696 aa  52  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  24.32 
 
 		 700 aa  52  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.32 
 
 		 696 aa  52  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  24.32 
 
 		 700 aa  52  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.32 
 
 		 696 aa  52  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.32 
 
 		 696 aa  52  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.32 
 
 		 696 aa  52  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  24.84 
 
 		 711 aa  51.2  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.32 
 
 		 706 aa  50.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  21.47 
 
 		 347 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.32 
 
 		 706 aa  50.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  27.66 
 
 		 631 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1850  hypothetical protein  22.09 
 
 		 652 aa  48.1  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.4 
 
 		 708 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  25.34 
 
 		 659 aa  48.5  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  25.45 
 
 		 733 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  23.11 
 
 		 727 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  23.03 
 
 		 700 aa  47.8  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  27.17 
 
 		 687 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.74 
 
 		 700 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  24.52 
 
 		 721 aa  46.6  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  25 
 
 		 733 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  24 
 
 		 395 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.99 
 
 		 724 aa  45.8  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  25 
 
 		 696 aa  46.2  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.05 
 
 		 763 aa  45.8  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.51 
 
 		 730 aa  45.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  23.44 
 
 		 764 aa  45.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.29 
 
 		 692 aa  44.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  21.69 
 
 		 758 aa  44.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>