95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4661 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4661  hypothetical protein  100 
 
 		 776 aa  1509    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2925  membrane protein-like protein  37.91 
 
 		 749 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119201  hitchhiker  0.0000166782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0258  hypothetical protein  33.74 
 
 		 829 aa  300  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0075  membrane protein-like protein  34.51 
 
 		 718 aa  261  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986959  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0094  membrane protein-like protein  34.51 
 
 		 718 aa  261  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0085  membrane protein-like protein  34.51 
 
 		 718 aa  261  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4074  membrane protein-like  35.15 
 
 		 889 aa  258  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7033  hypothetical protein  31.48 
 
 		 874 aa  243  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  39.36 
 
 		 745 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0100  membrane protein-like protein  39.37 
 
 		 715 aa  164  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0746  membrane protein-like protein  40.91 
 
 		 712 aa  144  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3554  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.41 
 
 		 728 aa  118  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0186862  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  36.42 
 
 		 727 aa  85.1  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.53 
 
 		 740 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  29.51 
 
 		 721 aa  75.5  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  28.46 
 
 		 717 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  26.34 
 
 		 725 aa  67.8  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  28.04 
 
 		 731 aa  66.2  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  22.34 
 
 		 740 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  23.28 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  23.98 
 
 		 711 aa  63.9  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  24.52 
 
 		 712 aa  61.6  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  24.52 
 
 		 712 aa  61.6  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  24.52 
 
 		 712 aa  61.6  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  22.82 
 
 		 711 aa  61.6  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  24.52 
 
 		 717 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  24.52 
 
 		 717 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  24.52 
 
 		 717 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.44 
 
 		 746 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  24.52 
 
 		 717 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  24.66 
 
 		 717 aa  60.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  24.14 
 
 		 717 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.91 
 
 		 719 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  27.78 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  23.75 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  28.9 
 
 		 631 aa  57.4  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  23.37 
 
 		 720 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  23.37 
 
 		 720 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  23.37 
 
 		 720 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  23.37 
 
 		 717 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  23.37 
 
 		 717 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  23.37 
 
 		 720 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  23.37 
 
 		 720 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  23.37 
 
 		 720 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  24.21 
 
 		 770 aa  55.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  24.8 
 
 		 338 aa  53.5  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  23.7 
 
 		 790 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.63 
 
 		 727 aa  52.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0564  hypothetical protein  22.22 
 
 		 653 aa  52.4  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  26.94 
 
 		 734 aa  52.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  26.21 
 
 		 431 aa  52.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.63 
 
 		 727 aa  52  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.07 
 
 		 727 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.07 
 
 		 727 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.07 
 
 		 727 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  21.53 
 
 		 733 aa  50.8  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  23.95 
 
 		 720 aa  50.8  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  23.41 
 
 		 700 aa  50.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.64 
 
 		 724 aa  50.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.12 
 
 		 727 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.41 
 
 		 700 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  21.7 
 
 		 708 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  27.81 
 
 		 372 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.07 
 
 		 720 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  27.81 
 
 		 372 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  27.81 
 
 		 372 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  28.83 
 
 		 638 aa  48.5  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  25.45 
 
 		 737 aa  48.5  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  24.24 
 
 		 727 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  27.22 
 
 		 374 aa  48.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  27.49 
 
 		 733 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2059  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.86 
 
 		 657 aa  47.8  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000771664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  21.35 
 
 		 721 aa  47  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  27.03 
 
 		 600 aa  47.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6403  cyclic nucleotide-binding protein  28.38 
 
 		 692 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.7 
 
 		 706 aa  47  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  34.41 
 
 		 740 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  22.73 
 
 		 659 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.87 
 
 		 730 aa  46.2  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1850  hypothetical protein  22.63 
 
 		 652 aa  47  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  23.22 
 
 		 732 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.12 
 
 		 706 aa  46.2  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.12 
 
 		 706 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  22.96 
 
 		 354 aa  45.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3567  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.53 
 
 		 746 aa  44.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.28 
 
 		 725 aa  44.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  44.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  27.01 
 
 		 733 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.65 
 
 		 696 aa  44.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  24.72 
 
 		 360 aa  44.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  28.82 
 
 		 361 aa  44.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  32.19 
 
 		 680 aa  44.3  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3629  membrane protein  24.86 
 
 		 647 aa  44.3  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  23.33 
 
 		 347 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  26.81 
 
 		 388 aa  44.3  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>