114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3554 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  74.14 
 
 		 727 aa  998    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3554  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  100 
 
 		 728 aa  1425    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0186862  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2925  membrane protein-like protein  30.58 
 
 		 749 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119201  hitchhiker  0.0000166782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0085  membrane protein-like protein  26.69 
 
 		 718 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0094  membrane protein-like protein  26.69 
 
 		 718 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0075  membrane protein-like protein  26.69 
 
 		 718 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986959  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  37.05 
 
 		 745 aa  113  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0746  membrane protein-like protein  27.63 
 
 		 712 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0100  membrane protein-like protein  26.24 
 
 		 715 aa  97.8  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4661  hypothetical protein  35.4 
 
 		 776 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0258  hypothetical protein  34.54 
 
 		 829 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  23.01 
 
 		 734 aa  81.3  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 874 aa  80.5  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4074  membrane protein-like  32.97 
 
 		 889 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  22.75 
 
 		 717 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.61 
 
 		 720 aa  75.1  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  23.11 
 
 		 725 aa  74.3  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.32 
 
 		 730 aa  72  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  21.08 
 
 		 717 aa  72  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.25 
 
 		 756 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  33.33 
 
 		 727 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  33.33 
 
 		 727 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  27.95 
 
 		 733 aa  63.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  30.63 
 
 		 721 aa  62.4  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  28.93 
 
 		 731 aa  61.2  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  27.84 
 
 		 720 aa  60.8  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  27.84 
 
 		 720 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.03 
 
 		 740 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  26.84 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.84 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  27.32 
 
 		 717 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  27.32 
 
 		 720 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  27.32 
 
 		 720 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  27.32 
 
 		 720 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  27.32 
 
 		 720 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  26.84 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.84 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.41 
 
 		 695 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  27.32 
 
 		 720 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  27.32 
 
 		 717 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.68 
 
 		 746 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.44 
 
 		 764 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.4 
 
 		 719 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  22.87 
 
 		 764 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  22.87 
 
 		 764 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.24 
 
 		 708 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  25.13 
 
 		 770 aa  55.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.84 
 
 		 695 aa  55.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.38 
 
 		 763 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  24.74 
 
 		 763 aa  54.7  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  29.67 
 
 		 700 aa  55.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  26.8 
 
 		 720 aa  55.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.1 
 
 		 727 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  24.88 
 
 		 732 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  24.88 
 
 		 732 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  22.68 
 
 		 763 aa  54.3  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.05 
 
 		 724 aa  54.3  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  26.8 
 
 		 717 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  26.8 
 
 		 717 aa  54.3  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  25.71 
 
 		 712 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  25.71 
 
 		 712 aa  53.9  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  25.71 
 
 		 712 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.32 
 
 		 699 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  26.8 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  26.8 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  26.8 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.38 
 
 		 746 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.7 
 
 		 727 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  29.1 
 
 		 733 aa  53.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.7 
 
 		 727 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  26.75 
 
 		 733 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  25.39 
 
 		 711 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.71 
 
 		 763 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.25 
 
 		 727 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.46 
 
 		 806 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  27.5 
 
 		 711 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  28.48 
 
 		 711 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  23.04 
 
 		 758 aa  52.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  23.16 
 
 		 338 aa  52  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  25.11 
 
 		 700 aa  50.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.57 
 
 		 851 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  26.09 
 
 		 883 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  22.83 
 
 		 721 aa  49.7  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  25.88 
 
 		 733 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  27.66 
 
 		 737 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.04 
 
 		 706 aa  49.3  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.77 
 
 		 696 aa  48.9  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.51 
 
 		 706 aa  49.3  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.04 
 
 		 706 aa  49.3  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.56 
 
 		 700 aa  48.9  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3465  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  33.14 
 
 		 660 aa  48.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.487354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  22.71 
 
 		 758 aa  47.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  23.46 
 
 		 758 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  22.71 
 
 		 758 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  23.14 
 
 		 727 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  23.46 
 
 		 758 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  23.46 
 
 		 758 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  22.71 
 
 		 758 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  23.46 
 
 		 758 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  28.87 
 
 		 631 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>