103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7033 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4074  membrane protein-like  79.58 
 
 		 889 aa  1157    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0258  hypothetical protein  51.39 
 
 		 829 aa  679    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7033  hypothetical protein  100 
 
 		 874 aa  1686    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  38.24 
 
 		 745 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0085  membrane protein-like protein  32.13 
 
 		 718 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0094  membrane protein-like protein  32.13 
 
 		 718 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0075  membrane protein-like protein  32.13 
 
 		 718 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986959  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2925  membrane protein-like protein  32.71 
 
 		 749 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119201  hitchhiker  0.0000166782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4661  hypothetical protein  35.43 
 
 		 776 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0746  membrane protein-like protein  35.28 
 
 		 712 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0100  membrane protein-like protein  35.6 
 
 		 715 aa  174  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  35.63 
 
 		 727 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  26.09 
 
 		 695 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  26.09 
 
 		 695 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.09 
 
 		 695 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.09 
 
 		 695 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3554  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  34.95 
 
 		 728 aa  69.3  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0186862  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.54 
 
 		 695 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  33.56 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  33.56 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.67 
 
 		 719 aa  67.8  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  25.35 
 
 		 725 aa  67.4  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  27.4 
 
 		 721 aa  67.4  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0564  hypothetical protein  20.71 
 
 		 653 aa  65.5  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.3 
 
 		 706 aa  62.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  25.82 
 
 		 731 aa  62.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  24.54 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.17 
 
 		 696 aa  62  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.52 
 
 		 706 aa  61.6  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.52 
 
 		 706 aa  61.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  28.42 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  26.63 
 
 		 700 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.63 
 
 		 696 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.63 
 
 		 696 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.63 
 
 		 696 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.63 
 
 		 696 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.63 
 
 		 696 aa  60.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.63 
 
 		 696 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  26.63 
 
 		 700 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  23.47 
 
 		 721 aa  60.1  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.12 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.7 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  28.57 
 
 		 717 aa  58.9  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  25.46 
 
 		 711 aa  58.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  28.86 
 
 		 737 aa  58.2  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  27.01 
 
 		 347 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1080  FlhB domain-containing protein  22.89 
 
 		 649 aa  57.4  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.990199  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1850  hypothetical protein  24.86 
 
 		 652 aa  56.6  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  23.13 
 
 		 733 aa  55.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  27.89 
 
 		 717 aa  55.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.14 
 
 		 746 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  27.65 
 
 		 711 aa  55.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.51 
 
 		 756 aa  55.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  26.88 
 
 		 720 aa  54.3  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  26.88 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  26.88 
 
 		 720 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  26.88 
 
 		 720 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  26.88 
 
 		 720 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  26.88 
 
 		 720 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  26.88 
 
 		 720 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  26.88 
 
 		 720 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  26.88 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  27.22 
 
 		 727 aa  53.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  26.48 
 
 		 711 aa  52.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  24.32 
 
 		 700 aa  52.4  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  30.6 
 
 		 431 aa  52  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  28.29 
 
 		 717 aa  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  28.29 
 
 		 717 aa  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  25.62 
 
 		 717 aa  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  28.29 
 
 		 717 aa  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  28.29 
 
 		 717 aa  51.6  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  27.67 
 
 		 687 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.32 
 
 		 700 aa  51.6  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  25.93 
 
 		 732 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  24.46 
 
 		 680 aa  50.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.44 
 
 		 730 aa  50.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  25.93 
 
 		 732 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  27.1 
 
 		 720 aa  49.7  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.56 
 
 		 740 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.24 
 
 		 720 aa  50.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  25.82 
 
 		 712 aa  48.9  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  31.18 
 
 		 363 aa  48.9  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  26.85 
 
 		 359 aa  48.9  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  25 
 
 		 727 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  25.82 
 
 		 712 aa  48.9  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  28.12 
 
 		 734 aa  48.5  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25 
 
 		 727 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  25 
 
 		 727 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  24.07 
 
 		 764 aa  48.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  23.6 
 
 		 712 aa  48.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  27.06 
 
 		 631 aa  48.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  24.87 
 
 		 664 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.06 
 
 		 708 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.32 
 
 		 727 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  36.73 
 
 		 679 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  30.41 
 
 		 659 aa  47  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.89 
 
 		 724 aa  47  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  29.63 
 
 		 733 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.29 
 
 		 746 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  27.1 
 
 		 364 aa  45.8  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.638215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>