48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1080 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1850  hypothetical protein  52.08 
 
 		 652 aa  641    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1080  FlhB domain-containing protein  100 
 
 		 649 aa  1275    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.990199  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0564  hypothetical protein  37.27 
 
 		 653 aa  372  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  19.69 
 
 		 883 aa  53.9  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.99 
 
 		 719 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.63 
 
 		 695 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0075  membrane protein-like protein  21.58 
 
 		 718 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986959  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0094  membrane protein-like protein  21.58 
 
 		 718 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0085  membrane protein-like protein  21.58 
 
 		 718 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.62 
 
 		 696 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.09 
 
 		 695 aa  50.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  26.09 
 
 		 695 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  26.09 
 
 		 695 aa  50.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0100  membrane protein-like protein  21.96 
 
 		 715 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.09 
 
 		 695 aa  50.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19 
 
 		 851 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.62 
 
 		 696 aa  50.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.62 
 
 		 696 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.62 
 
 		 696 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  25.62 
 
 		 700 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.62 
 
 		 696 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.62 
 
 		 696 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.62 
 
 		 696 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  25.62 
 
 		 700 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  20.69 
 
 		 758 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  20.69 
 
 		 758 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  20.69 
 
 		 758 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  20.69 
 
 		 758 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  20.69 
 
 		 758 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  20.69 
 
 		 758 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.99 
 
 		 738 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  20.69 
 
 		 758 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  21.55 
 
 		 717 aa  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.99 
 
 		 738 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7033  hypothetical protein  23.45 
 
 		 874 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.94 
 
 		 745 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  19.54 
 
 		 758 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  17.56 
 
 		 806 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1137  hypothetical protein  22.88 
 
 		 640 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0462  hypothetical protein  24.59 
 
 		 345 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000893155  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  18.85 
 
 		 763 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0981  hypothetical protein  24.86 
 
 		 620 aa  45.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229606  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.78 
 
 		 730 aa  45.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0450  hypothetical protein  24.59 
 
 		 345 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.376108  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  23.81 
 
 		 217 aa  44.3  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  23.84 
 
 		 217 aa  44.3  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  18.12 
 
 		 763 aa  43.9  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  18.12 
 
 		 763 aa  43.9  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>