86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0564 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0564  hypothetical protein  100 
 
 		 653 aa  1293    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1850  hypothetical protein  38.78 
 
 		 652 aa  442  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1080  FlhB domain-containing protein  37.27 
 
 		 649 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.990199  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0100  membrane protein-like protein  27.88 
 
 		 715 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0075  membrane protein-like protein  25 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986959  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0094  membrane protein-like protein  25 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0085  membrane protein-like protein  25 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2925  membrane protein-like protein  24.02 
 
 		 749 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119201  hitchhiker  0.0000166782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  24.07 
 
 		 764 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.46 
 
 		 763 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  24.07 
 
 		 764 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.07 
 
 		 764 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.46 
 
 		 763 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.46 
 
 		 763 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.46 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  23.46 
 
 		 758 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  23.46 
 
 		 758 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  23.46 
 
 		 758 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  23.46 
 
 		 758 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  23.46 
 
 		 758 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  23.46 
 
 		 758 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  23.46 
 
 		 758 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  23.46 
 
 		 758 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.28 
 
 		 745 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4074  membrane protein-like  25.68 
 
 		 889 aa  61.2  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7033  hypothetical protein  23.78 
 
 		 874 aa  60.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0746  membrane protein-like protein  25.85 
 
 		 712 aa  60.8  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4661  hypothetical protein  21.47 
 
 		 776 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  21.35 
 
 		 883 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.43 
 
 		 806 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.79 
 
 		 851 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  21.89 
 
 		 733 aa  54.7  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0258  hypothetical protein  22.49 
 
 		 829 aa  54.3  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  22.67 
 
 		 721 aa  51.6  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25 
 
 		 695 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25 
 
 		 695 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  25 
 
 		 695 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  25 
 
 		 695 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  25 
 
 		 717 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  25 
 
 		 717 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.1 
 
 		 719 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  19.8 
 
 		 740 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  26.43 
 
 		 731 aa  49.7  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  25 
 
 		 717 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  25 
 
 		 711 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.34 
 
 		 695 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  25 
 
 		 717 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  23.86 
 
 		 711 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  25 
 
 		 717 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  18.79 
 
 		 746 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  18.37 
 
 		 738 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.22 
 
 		 730 aa  48.1  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  21.14 
 
 		 338 aa  48.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  24.11 
 
 		 717 aa  47.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1951  conserved hypothetical conserved membrane protein  22.71 
 
 		 677 aa  47.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126596  normal  0.313547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2162  conserved hypothetical conserved membrane protein  22.01 
 
 		 679 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547772  normal  0.0766716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  17.53 
 
 		 738 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  25 
 
 		 721 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  23.53 
 
 		 720 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  23.53 
 
 		 717 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  26.47 
 
 		 712 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  23.53 
 
 		 720 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  23.53 
 
 		 720 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3199  hypothetical protein  18.92 
 
 		 700 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000232699  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  20.77 
 
 		 727 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  28.57 
 
 		 720 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  26.47 
 
 		 712 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  23.53 
 
 		 720 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  23.53 
 
 		 720 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  23.53 
 
 		 717 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  23.53 
 
 		 720 aa  45.8  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  23.53 
 
 		 720 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  26.47 
 
 		 712 aa  45.8  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.44 
 
 		 740 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.32 
 
 		 696 aa  45.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  25.32 
 
 		 700 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.32 
 
 		 696 aa  45.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.32 
 
 		 696 aa  45.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.32 
 
 		 696 aa  45.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.32 
 
 		 696 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.32 
 
 		 696 aa  45.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.32 
 
 		 696 aa  45.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  25.32 
 
 		 700 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1518  hypothetical protein  26.28 
 
 		 666 aa  44.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  17.76 
 
 		 600 aa  43.9  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0446  hypothetical protein  29.03 
 
 		 606 aa  43.9  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0398916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>