169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3465 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3465  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  100 
 
 		 660 aa  1261    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.487354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3629  membrane protein  35.62 
 
 		 647 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2059  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  34.34 
 
 		 657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000771664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  35.82 
 
 		 631 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36930  predicted membrane protein  38.38 
 
 		 650 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0672336 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  26.96 
 
 		 600 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  37.59 
 
 		 372 aa  95.1  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.03 
 
 		 708 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.23 
 
 		 719 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.39 
 
 		 691 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.33 
 
 		 737 aa  89.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.26 
 
 		 730 aa  88.2  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.29 
 
 		 746 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.14 
 
 		 746 aa  85.1  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.38 
 
 		 695 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.38 
 
 		 695 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.38 
 
 		 695 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  23.38 
 
 		 695 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  23.72 
 
 		 695 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  24.11 
 
 		 740 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.47 
 
 		 695 aa  80.1  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  31.31 
 
 		 740 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  25.5 
 
 		 717 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.19 
 
 		 738 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  18.98 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25 
 
 		 763 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.72 
 
 		 738 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0570  hypothetical protein  39.72 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  18.67 
 
 		 632 aa  77  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.79 
 
 		 851 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.45 
 
 		 720 aa  75.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.61 
 
 		 806 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.1 
 
 		 763 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  27.73 
 
 		 717 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  27.73 
 
 		 717 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  27.73 
 
 		 717 aa  73.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  27.73 
 
 		 717 aa  73.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  27.73 
 
 		 717 aa  73.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  22.86 
 
 		 758 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  24.1 
 
 		 763 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  24.1 
 
 		 763 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.21 
 
 		 740 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  32.04 
 
 		 706 aa  72  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  22.86 
 
 		 758 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  22.86 
 
 		 758 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  29.27 
 
 		 725 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.53 
 
 		 764 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  27.96 
 
 		 721 aa  71.2  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  26.7 
 
 		 721 aa  71.2  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  22.86 
 
 		 758 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  23.64 
 
 		 717 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  28.09 
 
 		 737 aa  71.2  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  22.08 
 
 		 883 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  22.29 
 
 		 734 aa  70.5  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  34.05 
 
 		 696 aa  70.5  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  23.25 
 
 		 758 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  28.64 
 
 		 790 aa  69.7  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  23.25 
 
 		 758 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  23.25 
 
 		 758 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  23.25 
 
 		 758 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.49 
 
 		 706 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.49 
 
 		 706 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  24.81 
 
 		 764 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  24.81 
 
 		 764 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  26.79 
 
 		 700 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  26.79 
 
 		 700 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.79 
 
 		 696 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.79 
 
 		 696 aa  67.4  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.79 
 
 		 696 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.79 
 
 		 696 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.79 
 
 		 696 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.79 
 
 		 696 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  27.94 
 
 		 731 aa  67  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  29.75 
 
 		 733 aa  65.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  20.87 
 
 		 650 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  32.18 
 
 		 680 aa  65.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  25.24 
 
 		 712 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  26.6 
 
 		 720 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.42 
 
 		 696 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  26.6 
 
 		 717 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  26.6 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  26.6 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  25.24 
 
 		 712 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  26.6 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  26.6 
 
 		 720 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  26.6 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  26.6 
 
 		 717 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  27.86 
 
 		 720 aa  64.7  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00757  hypothetical protein  28.26 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0943161  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0284  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  35.14 
 
 		 744 aa  64.3  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  26.24 
 
 		 720 aa  63.9  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  25.24 
 
 		 712 aa  63.9  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.65 
 
 		 756 aa  63.9  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.37 
 
 		 699 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  31.71 
 
 		 764 aa  63.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3199  hypothetical protein  29.38 
 
 		 700 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000232699  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  29.08 
 
 		 700 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  26.67 
 
 		 733 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  26.35 
 
 		 733 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1207  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  30.94 
 
 		 688 aa  62.4  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00411304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>