59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1809 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1809  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  358  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1742  hypothetical protein  99.43 
 
 		 176 aa  356  8e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2684  hypothetical protein  33.54 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.497054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  30.82 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  32.43 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  32.43 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  32.43 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  23.98 
 
 		 359 aa  51.6  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  24.7 
 
 		 338 aa  51.6  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  25.6 
 
 		 676 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  27.38 
 
 		 676 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  25.97 
 
 		 347 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.65 
 
 		 699 aa  48.9  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  25.6 
 
 		 676 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  30.71 
 
 		 679 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  27.34 
 
 		 718 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  27.63 
 
 		 695 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  27.63 
 
 		 695 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  31.76 
 
 		 664 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  27.63 
 
 		 695 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  31.17 
 
 		 664 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 		 673 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 		 673 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 		 673 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  29.32 
 
 		 363 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  27.63 
 
 		 695 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  30.89 
 
 		 679 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  22.98 
 
 		 363 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.47 
 
 		 672 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.58 
 
 		 700 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  22.08 
 
 		 720 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  23.97 
 
 		 360 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  28.47 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  24.83 
 
 		 361 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  27.27 
 
 		 374 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  28.47 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  25.95 
 
 		 700 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4804  membrane protein-like protein  31.2 
 
 		 352 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  23.74 
 
 		 687 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  28.03 
 
 		 687 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  25.17 
 
 		 682 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  27.27 
 
 		 372 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  27.27 
 
 		 372 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  27.27 
 
 		 372 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  28.93 
 
 		 371 aa  41.6  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  21.88 
 
 		 653 aa  42  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  27.27 
 
 		 389 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  21.92 
 
 		 720 aa  41.2  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  27.27 
 
 		 388 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  25 
 
 		 698 aa  41.2  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  27.27 
 
 		 380 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  27.27 
 
 		 389 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  23.65 
 
 		 217 aa  40.8  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  21.92 
 
 		 720 aa  40.8  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  21.92 
 
 		 720 aa  40.8  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  23.65 
 
 		 217 aa  40.8  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  21.92 
 
 		 720 aa  40.8  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  21.92 
 
 		 720 aa  40.8  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>