More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0043 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0043  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  50.64 
 
 
236 aa  248  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50 
 
 
234 aa  243  2e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
234 aa  242  4e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  48.09 
 
 
236 aa  241  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  48.07 
 
 
233 aa  240  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  51.05 
 
 
238 aa  239  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  52.56 
 
 
235 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  50.85 
 
 
234 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  48.5 
 
 
233 aa  238  6e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  51.28 
 
 
233 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.04533e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  50.64 
 
 
235 aa  237  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  49.57 
 
 
239 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.29058e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  52.12 
 
 
236 aa  236  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  48.72 
 
 
234 aa  234  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  46.81 
 
 
236 aa  233  1e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
235 aa  234  1e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  48.5 
 
 
235 aa  233  2e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  47.44 
 
 
234 aa  233  2e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  50.43 
 
 
234 aa  233  2e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  49.15 
 
 
237 aa  232  4e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  49.36 
 
 
239 aa  232  4e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  49.79 
 
 
235 aa  231  7e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  48.51 
 
 
251 aa  231  8e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50.64 
 
 
238 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
234 aa  231  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  45.73 
 
 
238 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 
238 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.73 
 
 
238 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  2.14299e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.73 
 
 
238 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.73 
 
 
238 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  3.50992e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.73 
 
 
238 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.73 
 
 
238 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  2.6853e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 
234 aa  229  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 
238 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  49.37 
 
 
239 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.94 
 
 
239 aa  228  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  46.15 
 
 
238 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  46.15 
 
 
238 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  51.9 
 
 
237 aa  228  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
234 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  7.96203e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  45.73 
 
 
238 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  45.73 
 
 
238 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  45.73 
 
 
238 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  45.73 
 
 
238 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  50.21 
 
 
238 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  48.94 
 
 
235 aa  227  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 
238 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  51.03 
 
 
248 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  51.48 
 
 
241 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.09 
 
 
237 aa  226  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  50.83 
 
 
253 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  48.5 
 
 
234 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.54 
 
 
239 aa  226  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  48.07 
 
 
237 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  47.21 
 
 
236 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 
234 aa  225  5e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.73 
 
 
238 aa  225  5e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  47.23 
 
 
236 aa  225  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 
236 aa  223  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  46.35 
 
 
234 aa  224  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  45.49 
 
 
239 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  46.78 
 
 
236 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  50.85 
 
 
238 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  45.49 
 
 
264 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  44.73 
 
 
237 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  46.35 
 
 
230 aa  223  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  49.36 
 
 
238 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  50.62 
 
 
270 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  46.35 
 
 
241 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.84565e-07 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  50.42 
 
 
237 aa  222  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  45.49 
 
 
265 aa  222  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  45.06 
 
 
238 aa  222  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  48.32 
 
 
256 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  44.21 
 
 
238 aa  222  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  48.52 
 
 
248 aa  222  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  48.1 
 
 
247 aa  222  5e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  48.1 
 
 
247 aa  222  5e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  45.15 
 
 
239 aa  221  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  48.93 
 
 
234 aa  221  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  45.06 
 
 
238 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  45.06 
 
 
238 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  48.1 
 
 
247 aa  221  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  49.36 
 
 
238 aa  221  1e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 
233 aa  220  1e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 
235 aa  221  1e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  47.86 
 
 
245 aa  220  1e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  52.14 
 
 
239 aa  220  2e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 
238 aa  220  2e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  47.44 
 
 
233 aa  219  2e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  47.64 
 
 
233 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  47.7 
 
 
253 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  48.29 
 
 
237 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  49.15 
 
 
234 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  47.46 
 
 
237 aa  219  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  48.51 
 
 
236 aa  219  4e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  44.21 
 
 
238 aa  219  4e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  47.86 
 
 
235 aa  219  4e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  52.14 
 
 
239 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>