More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0008 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0008  ABC transporter related  100 
 
 
258 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419449  hitchhiker  0.000235622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  77.45 
 
 
238 aa  362  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0899  ABC transporter related  70.76 
 
 
238 aa  330  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  53.65 
 
 
233 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
234 aa  238  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  52.36 
 
 
234 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  51.93 
 
 
234 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  51.07 
 
 
234 aa  235  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  48.5 
 
 
234 aa  235  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  52.36 
 
 
235 aa  234  1e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 
235 aa  233  2e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  49.58 
 
 
237 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  49.57 
 
 
234 aa  231  7e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  48.72 
 
 
234 aa  229  4e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  50.43 
 
 
240 aa  228  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  49.14 
 
 
234 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  49.79 
 
 
236 aa  228  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  46.35 
 
 
231 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  48.73 
 
 
237 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  47.64 
 
 
234 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 
235 aa  225  5e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  47.97 
 
 
258 aa  225  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.84 
 
 
236 aa  224  7e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  44.53 
 
 
256 aa  224  8e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  50 
 
 
245 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  48.52 
 
 
238 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  48.52 
 
 
238 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
259 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  47.21 
 
 
234 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  46.35 
 
 
234 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.64 
 
 
234 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  47.21 
 
 
234 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  48.28 
 
 
238 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3396  ABC transporter related  49.79 
 
 
238 aa  222  5e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0282544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  47.84 
 
 
234 aa  222  5e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  47.81 
 
 
257 aa  222  5e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  48.72 
 
 
234 aa  222  6e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  1.16911e-06  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  50.43 
 
 
236 aa  221  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  48.24 
 
 
294 aa  221  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6492  ABC transporter related  49.57 
 
 
244 aa  221  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0130202  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  47.01 
 
 
238 aa  221  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  49.79 
 
 
246 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  48.52 
 
 
234 aa  221  1e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  49.79 
 
 
244 aa  221  1e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  49.79 
 
 
254 aa  221  1e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  50.21 
 
 
246 aa  220  2e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  46.55 
 
 
234 aa  220  2e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  47.64 
 
 
437 aa  220  2e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  6.3148e-08 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  47.84 
 
 
233 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.04533e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  48.5 
 
 
234 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 
234 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  46.12 
 
 
237 aa  219  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  47.84 
 
 
238 aa  218  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  45.92 
 
 
235 aa  218  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  49.57 
 
 
242 aa  218  9e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.68 
 
 
238 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  46.78 
 
 
233 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  46.98 
 
 
236 aa  217  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  49.15 
 
 
241 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  46.15 
 
 
234 aa  217  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  47.88 
 
 
240 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  48.5 
 
 
236 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
243 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  46.78 
 
 
239 aa  216  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  48.07 
 
 
237 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.71 
 
 
235 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  49.15 
 
 
245 aa  216  3e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  49.14 
 
 
233 aa  216  3e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  45.69 
 
 
238 aa  216  3e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  44.49 
 
 
242 aa  216  3e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  48.28 
 
 
235 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  47.44 
 
 
234 aa  216  4e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  48.71 
 
 
235 aa  216  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  47.64 
 
 
238 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2169  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  215  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
248 aa  215  6e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2212  ABC transporter, ATPase subunit  47.88 
 
 
247 aa  215  6e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.618749 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3056  ABC transporter related  48.93 
 
 
237 aa  215  6e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  46.55 
 
 
236 aa  215  6e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6017  ABC transporter related  48.1 
 
 
251 aa  215  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.896257  hitchhiker  0.00867061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  47.01 
 
 
251 aa  214  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  44.92 
 
 
236 aa  214  8e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  46.69 
 
 
248 aa  214  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  46.35 
 
 
239 aa  214  9e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  50.21 
 
 
241 aa  214  1e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
235 aa  214  1e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  50.21 
 
 
241 aa  214  1e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  46.55 
 
 
238 aa  214  1e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  45.76 
 
 
240 aa  213  2e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  48.29 
 
 
244 aa  213  2e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  47.28 
 
 
239 aa  213  2e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
234 aa  213  2e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 
233 aa  213  2e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  47.41 
 
 
235 aa  213  2e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1466  ABC transporter-like protein  48.52 
 
 
271 aa  214  2e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  48.5 
 
 
233 aa  213  2e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  46.19 
 
 
240 aa  213  3e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2614  ABC transporter related  48.51 
 
 
247 aa  213  3e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796579  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  49.15 
 
 
694 aa  212  4e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  47.84 
 
 
234 aa  212  4e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>