More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1122 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 701 aa  1446    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  47.44 
 
 		 717 aa  568  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  45.73 
 
 		 745 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  47.29 
 
 		 717 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  44.65 
 
 		 719 aa  539  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  41.79 
 
 		 728 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  41.52 
 
 		 728 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  42.96 
 
 		 728 aa  504  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  42.3 
 
 		 665 aa  498  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  39.32 
 
 		 799 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  40.17 
 
 		 733 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  38.06 
 
 		 706 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  40.12 
 
 		 723 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  40.72 
 
 		 801 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  39.14 
 
 		 829 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  35.85 
 
 		 733 aa  433  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  38.68 
 
 		 710 aa  432  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  39.28 
 
 		 696 aa  428  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  36.83 
 
 		 806 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  37.88 
 
 		 729 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  37.09 
 
 		 806 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.93 
 
 		 833 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  38.42 
 
 		 821 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  36.19 
 
 		 738 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  37.18 
 
 		 789 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  35.63 
 
 		 802 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  38.17 
 
 		 683 aa  411  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 752 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  36.03 
 
 		 753 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  36.03 
 
 		 737 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  36.55 
 
 		 829 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  36.03 
 
 		 753 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 736 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 		 831 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.42 
 
 		 797 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 820 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 736 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  36.26 
 
 		 794 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 741 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  36.69 
 
 		 819 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  36.02 
 
 		 810 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  36.52 
 
 		 733 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  35.94 
 
 		 828 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  35.14 
 
 		 747 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 828 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 		 810 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  35.01 
 
 		 747 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  35.41 
 
 		 734 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  37.06 
 
 		 745 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  34.59 
 
 		 729 aa  391  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 		 797 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 828 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 748 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  34.32 
 
 		 729 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  34.89 
 
 		 750 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 778 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 		 810 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  35.04 
 
 		 810 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 		 808 aa  389  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  34.22 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  34.19 
 
 		 747 aa  389  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  34.5 
 
 		 747 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  34.36 
 
 		 747 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  34.36 
 
 		 747 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  34.27 
 
 		 752 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 		 753 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 729 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  34.58 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  34.58 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  34.68 
 
 		 808 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  34.45 
 
 		 745 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 705 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 701 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 		 817 aa  382  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  35.12 
 
 		 729 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  34.36 
 
 		 747 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  34.36 
 
 		 747 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 		 799 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 745 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  35.02 
 
 		 696 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  35.17 
 
 		 696 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  34.84 
 
 		 696 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  34.95 
 
 		 750 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  35.75 
 
 		 791 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  35.76 
 
 		 791 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 		 696 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  34.56 
 
 		 754 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  34.69 
 
 		 698 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6070  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 729 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 		 754 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 		 754 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  36.41 
 
 		 721 aa  372  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  34.91 
 
 		 750 aa  369  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  34.55 
 
 		 696 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6351  TonB-dependent siderophore receptor  34.5 
 
 		 725 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532557  normal  0.487523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 736 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6529  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 		 725 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6763  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 		 725 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  34.63 
 
 		 718 aa  362  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  34.2 
 
 		 717 aa  362  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>