More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0450 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  100 
 
 
579 aa  1202    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  46.95 
 
 
585 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  47.04 
 
 
580 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  46.86 
 
 
578 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  42.08 
 
 
581 aa  445  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  40.67 
 
 
586 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  39.78 
 
 
580 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  39.79 
 
 
577 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  39.36 
 
 
583 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  39.39 
 
 
592 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.82 
 
 
581 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  39.01 
 
 
583 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  37.46 
 
 
578 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  39.54 
 
 
583 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.37 
 
 
581 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.19 
 
 
581 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  39.22 
 
 
583 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  38.43 
 
 
580 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  38.37 
 
 
581 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  38.64 
 
 
573 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  30.51 
 
 
664 aa  240  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.09 
 
 
558 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.45 
 
 
523 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.45 
 
 
523 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  27.15 
 
 
607 aa  206  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.48 
 
 
601 aa  203  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  27.24 
 
 
581 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  27.93 
 
 
591 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.74 
 
 
555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  25.13 
 
 
526 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  26.61 
 
 
663 aa  187  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.99 
 
 
607 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  24.96 
 
 
529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  25.88 
 
 
532 aa  185  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  27.38 
 
 
584 aa  183  7e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  25.53 
 
 
520 aa  183  9.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  26.17 
 
 
625 aa  181  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.71 
 
 
587 aa  180  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.18 
 
 
605 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.17 
 
 
638 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.47 
 
 
533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.17 
 
 
627 aa  173  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  25.5 
 
 
641 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  25.31 
 
 
659 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  27.48 
 
 
504 aa  164  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  25.8 
 
 
637 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  24.34 
 
 
657 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  25.8 
 
 
637 aa  158  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  24.32 
 
 
663 aa  157  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.12 
 
 
672 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 
582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.11 
 
 
508 aa  134  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  24.06 
 
 
523 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  25.73 
 
 
515 aa  130  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.58 
 
 
509 aa  128  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.98 
 
 
515 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  22.98 
 
 
619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.96 
 
 
539 aa  115  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.42 
 
 
508 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.42 
 
 
508 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  25.21 
 
 
512 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.27 
 
 
516 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.92 
 
 
518 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.87 
 
 
503 aa  106  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.2 
 
 
1181 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  23.74 
 
 
518 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  28.76 
 
 
302 aa  102  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.5 
 
 
517 aa  102  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  25.2 
 
 
520 aa  101  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  23.41 
 
 
523 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  23.57 
 
 
518 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  23.57 
 
 
518 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  23.22 
 
 
520 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  23.75 
 
 
530 aa  99.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  23.22 
 
 
520 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.4 
 
 
518 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.43 
 
 
517 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.65 
 
 
1175 aa  98.2  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  23.62 
 
 
504 aa  98.2  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.03 
 
 
523 aa  96.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  29.35 
 
 
313 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.08 
 
 
1215 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  24.1 
 
 
772 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  24.1 
 
 
772 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.08 
 
 
1202 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  22.87 
 
 
489 aa  93.2  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.58 
 
 
549 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2264  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.94 
 
 
573 aa  91.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.96145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  29.72 
 
 
313 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10661  5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14310)  22.45 
 
 
666 aa  90.9  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.58 
 
 
549 aa  90.9  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2311  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.2 
 
 
572 aa  90.9  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2454  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.02 
 
 
573 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.09 
 
 
1284 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1760  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.45 
 
 
572 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0372367  hitchhiker  0.00627881 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3473  metallophosphoesterase  27.68 
 
 
303 aa  88.6  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.590454  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2336  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.46 
 
 
573 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27789  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2001  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.16 
 
 
569 aa  88.2  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0540  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.47 
 
 
550 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  29.23 
 
 
315 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>