More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004183 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  100 
 
 
320 aa  652  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  84.11 
 
 
318 aa  534  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  58.15 
 
 
321 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  42.01 
 
 
330 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.10155e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  39.58 
 
 
326 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.75354e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  40.45 
 
 
334 aa  220  2e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  37.46 
 
 
321 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  30.7 
 
 
367 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  32.17 
 
 
342 aa  148  1e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  30.73 
 
 
353 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  8.8038e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  30.73 
 
 
357 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  31.51 
 
 
356 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  30.73 
 
 
353 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  3.81188e-11  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  31.39 
 
 
355 aa  141  2e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  30.28 
 
 
358 aa  137  3e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  5.40093e-10  decreased coverage  5.07763e-07 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  29.25 
 
 
333 aa  137  3e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  31.81 
 
 
365 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  6.98773e-08  unclonable  2.77772e-08 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  31.81 
 
 
346 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.4176e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  31.81 
 
 
346 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  31.81 
 
 
354 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.16879e-08  normal  0.89417 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  31.81 
 
 
346 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.93272e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  31.81 
 
 
346 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  7.88885e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  31.81 
 
 
346 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  5.0212e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  30.68 
 
 
355 aa  134  2e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  3.42607e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  33.14 
 
 
351 aa  134  2e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  8.45833e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  31.43 
 
 
358 aa  132  7e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.95857e-08  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  31.71 
 
 
350 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.3965e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  30.59 
 
 
331 aa  130  2e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  31.05 
 
 
371 aa  129  9e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  2.86695e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  31.23 
 
 
369 aa  129  9e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  31.23 
 
 
358 aa  129  9e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  31.23 
 
 
358 aa  129  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  31.23 
 
 
369 aa  128  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  5.33703e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  29.97 
 
 
354 aa  127  2e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  1.18487e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  25.46 
 
 
369 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  28.97 
 
 
361 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.65079e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  28.25 
 
 
369 aa  117  2e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  28.25 
 
 
369 aa  117  2e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  28.73 
 
 
366 aa  114  2e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  28.98 
 
 
468 aa  113  4e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.80584e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  30.08 
 
 
355 aa  113  4e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  6.58717e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  31.39 
 
 
319 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  4.79334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 
367 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  25.36 
 
 
365 aa  112  7e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  30.88 
 
 
319 aa  112  8e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  27.79 
 
 
324 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  48.11 
 
 
220 aa  110  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  48.11 
 
 
220 aa  110  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  48.57 
 
 
219 aa  110  4e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  48.57 
 
 
219 aa  110  4e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  48.11 
 
 
220 aa  110  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  48.57 
 
 
219 aa  110  4e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  48.57 
 
 
219 aa  110  4e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  48.11 
 
 
220 aa  110  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  48.57 
 
 
219 aa  110  4e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  48.11 
 
 
220 aa  110  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  48.57 
 
 
219 aa  110  4e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  48.57 
 
 
219 aa  110  4e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  48.57 
 
 
219 aa  110  4e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  48.57 
 
 
219 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  27.59 
 
 
466 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08671e-14 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  25.86 
 
 
368 aa  109  7e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  27.4 
 
 
369 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  31.14 
 
 
319 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  24.93 
 
 
366 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  28.48 
 
 
359 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  27.12 
 
 
363 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.83072e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  28.82 
 
 
454 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.20866e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  30.94 
 
 
376 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  5.38127e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  48.08 
 
 
230 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  24.44 
 
 
372 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  50 
 
 
890 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  26.61 
 
 
377 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  43.4 
 
 
220 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  28.7 
 
 
341 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  48.51 
 
 
537 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  24.16 
 
 
372 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  45.79 
 
 
288 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.33592e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  25.35 
 
 
373 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  44.34 
 
 
220 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  44.34 
 
 
209 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  24.86 
 
 
370 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  44.44 
 
 
226 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  49.5 
 
 
231 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  50.51 
 
 
456 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 
209 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  42.99 
 
 
239 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.76 
 
 
498 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 
510 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  51.49 
 
 
209 aa  99.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  26.97 
 
 
457 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  52.22 
 
 
424 aa  99.4  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  48.21 
 
 
227 aa  99.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  31.74 
 
 
328 aa  99.4  8e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  49.5 
 
 
402 aa  99  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 
214 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  6.45517e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  35.21 
 
 
586 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  43.56 
 
 
422 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  44.86 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  44.86 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>