More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0095 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  100 
 
 
167 aa  336  8e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  70.91 
 
 
181 aa  239  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  70.91 
 
 
168 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  70.83 
 
 
171 aa  238  3e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  70.24 
 
 
171 aa  236  7e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  70.06 
 
 
167 aa  236  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  71.6 
 
 
169 aa  234  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  69.51 
 
 
167 aa  234  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  69.7 
 
 
168 aa  234  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  70.12 
 
 
167 aa  233  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  69.09 
 
 
167 aa  233  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  69.7 
 
 
167 aa  233  1e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  69.09 
 
 
179 aa  233  1e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  68.29 
 
 
167 aa  233  1e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  69.09 
 
 
167 aa  233  1e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  67.68 
 
 
167 aa  231  2e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  69.09 
 
 
167 aa  232  2e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  69.09 
 
 
167 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  69.09 
 
 
167 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  67.88 
 
 
179 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  67.68 
 
 
177 aa  228  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  67.88 
 
 
216 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  67.88 
 
 
167 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  67.88 
 
 
167 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  67.27 
 
 
179 aa  226  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  67.27 
 
 
167 aa  226  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  67.27 
 
 
179 aa  226  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  65.24 
 
 
191 aa  221  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  64.67 
 
 
177 aa  219  1e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  64.24 
 
 
171 aa  216  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  63.69 
 
 
170 aa  215  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  66.06 
 
 
169 aa  214  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  63.03 
 
 
171 aa  214  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  58.68 
 
 
169 aa  211  4e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  60.71 
 
 
168 aa  209  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  2.67775e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  61.31 
 
 
168 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  63.03 
 
 
178 aa  209  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  60.12 
 
 
168 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  60.12 
 
 
168 aa  208  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  61.9 
 
 
168 aa  208  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  1.33405e-06 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  66.67 
 
 
173 aa  208  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  60.61 
 
 
171 aa  207  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  61.82 
 
 
169 aa  206  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  64.24 
 
 
170 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  60.61 
 
 
178 aa  205  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  64.24 
 
 
170 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  60.71 
 
 
168 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  4.0176e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  60.71 
 
 
168 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  61.21 
 
 
168 aa  205  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  57.49 
 
 
169 aa  204  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  61.31 
 
 
168 aa  204  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  59.28 
 
 
169 aa  204  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  63.03 
 
 
173 aa  204  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  58.68 
 
 
170 aa  203  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  58.68 
 
 
170 aa  203  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  58.68 
 
 
170 aa  203  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  64.07 
 
 
178 aa  203  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  60.71 
 
 
168 aa  203  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  60.12 
 
 
168 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  4.47721e-15 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  61.35 
 
 
170 aa  201  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  60.84 
 
 
172 aa  201  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  59.76 
 
 
169 aa  200  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  58.58 
 
 
172 aa  199  1e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  58.68 
 
 
169 aa  198  2e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  58.68 
 
 
169 aa  199  2e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  57.58 
 
 
167 aa  198  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  57.58 
 
 
167 aa  198  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  60.24 
 
 
172 aa  198  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  58.08 
 
 
169 aa  197  4e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  58.08 
 
 
169 aa  197  4e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  58.08 
 
 
169 aa  197  4e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  58.08 
 
 
169 aa  197  4e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  58.08 
 
 
169 aa  197  4e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  58.08 
 
 
169 aa  197  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  58.08 
 
 
169 aa  196  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  58.08 
 
 
169 aa  196  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  58.08 
 
 
169 aa  196  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  58.08 
 
 
169 aa  196  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  58.08 
 
 
169 aa  196  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.66805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  58.08 
 
 
169 aa  196  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  58.08 
 
 
169 aa  196  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  58.43 
 
 
169 aa  196  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  58.79 
 
 
169 aa  196  1e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  57.49 
 
 
169 aa  194  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  57.49 
 
 
170 aa  195  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  58.08 
 
 
170 aa  194  4e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  61.82 
 
 
173 aa  194  4e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  55.69 
 
 
167 aa  194  5e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  55.69 
 
 
170 aa  194  5e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  56.71 
 
 
170 aa  194  5e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  56.71 
 
 
170 aa  194  5e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  58.9 
 
 
167 aa  192  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  56.1 
 
 
170 aa  190  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  56.1 
 
 
167 aa  189  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  56.89 
 
 
168 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  56.89 
 
 
168 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  55.69 
 
 
168 aa  189  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  59.01 
 
 
170 aa  188  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  56.89 
 
 
168 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.96537e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  56.1 
 
 
167 aa  188  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>