78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0797 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 
357 aa  718    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  47.8 
 
 
363 aa  350  3e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  47.53 
 
 
363 aa  343  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  42.82 
 
 
376 aa  306  5.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  37.06 
 
 
365 aa  249  6e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.79 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  32.7 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  32.7 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  32.7 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  32.7 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  32.7 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  32.7 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  32.7 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  32.43 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  32.43 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  32.79 
 
 
366 aa  182  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  32.79 
 
 
366 aa  182  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  30.08 
 
 
366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  31.34 
 
 
368 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.1 
 
 
391 aa  177  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  30.52 
 
 
368 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  30.16 
 
 
369 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  27.66 
 
 
396 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  29.62 
 
 
370 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  29.65 
 
 
372 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  31.89 
 
 
369 aa  157  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  28.73 
 
 
372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  28.65 
 
 
375 aa  150  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  27.69 
 
 
379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  28.07 
 
 
710 aa  129  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  29.08 
 
 
361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  27.61 
 
 
365 aa  124  2e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  24.42 
 
 
401 aa  123  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  25.42 
 
 
367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  26.74 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  33.2 
 
 
401 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  23.29 
 
 
604 aa  90.9  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  30.23 
 
 
560 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  26.99 
 
 
562 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10438  conserved hypothetical protein  20.88 
 
 
634 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.906693 
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  30.72 
 
 
717 aa  53.9  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  29.17 
 
 
534 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  38.37 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.6 
 
 
434 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  40.22 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  40 
 
 
416 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  43.4 
 
 
338 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  36.25 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  42.11 
 
 
435 aa  47  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  42.11 
 
 
435 aa  47  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1748  GTPase ObgE  41.54 
 
 
382 aa  47  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0657373  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  43.33 
 
 
346 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  43.33 
 
 
346 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  43.33 
 
 
346 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  29.38 
 
 
379 aa  46.2  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.02 
 
 
274 aa  45.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  42.86 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  40 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.67 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.22 
 
 
350 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  23.91 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  27.37 
 
 
345 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  39.29 
 
 
324 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  41.51 
 
 
347 aa  43.9  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.11 
 
 
327 aa  43.9  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  28.3 
 
 
374 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  42.86 
 
 
332 aa  43.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  29.29 
 
 
356 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  38.33 
 
 
424 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  38.03 
 
 
258 aa  43.1  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.68 
 
 
454 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  37.68 
 
 
439 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  36.67 
 
 
457 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  29.69 
 
 
384 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  37.31 
 
 
354 aa  42.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  35.42 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0536  putative GTP-binding protein EngA  30.83 
 
 
473 aa  42.7  0.009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  37.93 
 
 
666 aa  42.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>