161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4957 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 212 aa  423  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  68.37 
 
 		 224 aa  285  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  75.71 
 
 		 213 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  62.74 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  68.33 
 
 		 201 aa  245  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  66.48 
 
 		 227 aa  235  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 199 aa  231  9e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  65.19 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  56.25 
 
 		 213 aa  222  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  56.57 
 
 		 202 aa  217  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  54.85 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  56.68 
 
 		 203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  64.64 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  67.98 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  53.03 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  59.12 
 
 		 249 aa  194  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  63.48 
 
 		 181 aa  194  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  61.24 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  57.54 
 
 		 181 aa  184  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  52.91 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  56.42 
 
 		 181 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  53.8 
 
 		 180 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  55.43 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  48.81 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  50.49 
 
 		 199 aa  151  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  28.89 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  39.47 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  36.76 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  39.22 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  30.56 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  31.76 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  50.98 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  29.77 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  24.29 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  24.86 
 
 		 165 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  23.73 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  23.73 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  37.11 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  23.73 
 
 		 165 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  23.73 
 
 		 165 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  23.73 
 
 		 165 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  23.73 
 
 		 165 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 175 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  37.78 
 
 		 177 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 154 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 		 121 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  24.43 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  24.29 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 107 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  36.47 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  30.81 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  24.43 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  28.48 
 
 		 174 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  35.23 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  26.29 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  24.88 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  35.82 
 
 		 174 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  27.36 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  46.94 
 
 		 271 aa  45.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  32.94 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  33.94 
 
 		 168 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 176 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  23.43 
 
 		 185 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  35.16 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  39.74 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  27.86 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  25.9 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  45.83 
 
 		 277 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  32.21 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>