More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0876 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  59.15 
 
 		 236 aa  284  9e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  58.4 
 
 		 237 aa  278  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  49.79 
 
 		 241 aa  228  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  44.1 
 
 		 389 aa  181  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  40.26 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  39.13 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  37.66 
 
 		 240 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  38.66 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  40.35 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  39.5 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  39.5 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  39.2 
 
 		 237 aa  138  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  36.06 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  35.17 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  34.73 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  35.51 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  36.44 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  43.09 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  32.03 
 
 		 227 aa  129  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  39.13 
 
 		 226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  37.61 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  35.14 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  32.38 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  41.94 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  37.68 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  32.67 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  35.22 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  34.31 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  33.05 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  32.67 
 
 		 245 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  33.47 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  33.05 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  32.52 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  37.12 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  33.91 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  33.05 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  34.65 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  38.95 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  31.28 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  32.51 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  34.01 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  39.25 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  35.26 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  34.38 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  31.36 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  38.25 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  30.15 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  35.03 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  31.36 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  33.84 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  31.93 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  47.76 
 
 		 184 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  30.04 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  34.51 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  33.19 
 
 		 282 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  32.43 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  31.51 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  29.63 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  31.94 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  32.62 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  31.78 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  31.78 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  32.39 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  31.78 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  32.35 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  31.78 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  31.78 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  31.78 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  32.49 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  35.26 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  31.36 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  28.71 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  33.33 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  35.44 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  36.08 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  34.22 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  33.49 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  32.12 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  34.9 
 
 		 261 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  32.63 
 
 		 234 aa  98.2  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  31.91 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  35.18 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1030  glutamine amidotransferase class-I  36.41 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0044853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  32.22 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  33.18 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  32.47 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  31.79 
 
 		 251 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  36.32 
 
 		 267 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  31.79 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  29.78 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3486  glutamine amidotransferase  30.18 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>