229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3486 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3609  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 238 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00629536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3486  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 238 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3411  glutamine amidotransferase  98.32 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0545272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  92.44 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  58.16 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  55.7 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  51.48 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  49.16 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  50 
 
 		 239 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  50 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  49.58 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  49.58 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  49.58 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  47.46 
 
 		 241 aa  235  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  38.53 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  38.1 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  39.66 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  35.04 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  29.96 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  32.24 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  33.76 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  31.4 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  31.47 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  31.51 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  31.93 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  34.13 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  32.64 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  30.3 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  32.49 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  31.41 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  30.18 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  30.65 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  33 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  30.61 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  29.79 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  31.9 
 
 		 237 aa  92  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  29.29 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  30.3 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  30.3 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  28.79 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  27.78 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  29.29 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  28.32 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  30.69 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  27.73 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  30.26 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.29 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  31.19 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  31.19 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  30.27 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  31.19 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  30.69 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  32.79 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  30.85 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  30.69 
 
 		 236 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.83 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  27.57 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  29.83 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  30.2 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  28.95 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  34.48 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  27.73 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  33.89 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  27.73 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  27.73 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  27.73 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  27.73 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  27.73 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  27.73 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  30.26 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  32.76 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  28.42 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  30.39 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  29.27 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  30.99 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  32.02 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  31.28 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  30.26 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  28.19 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  33.77 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  28.65 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  28.65 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  38.52 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  28.42 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  25.95 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  29.38 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  32.9 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  27.59 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  25.76 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  28.12 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  25.99 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  29.29 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  27.47 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  28.26 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  34.53 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  28.43 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>