More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2283 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2283  permease, putative  100 
 
 		 412 aa  821    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  33.01 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  34.23 
 
 		 443 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  31.54 
 
 		 391 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  32.93 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  35.22 
 
 		 657 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  33.64 
 
 		 405 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  32.39 
 
 		 406 aa  166  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  31.8 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  30.47 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  30.8 
 
 		 409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  31.25 
 
 		 406 aa  162  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  32.54 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  33.25 
 
 		 657 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  32.3 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.41 
 
 		 417 aa  160  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  33.92 
 
 		 663 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  36.05 
 
 		 656 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  34.07 
 
 		 663 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  31.16 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  30.02 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  31.86 
 
 		 651 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.79 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  30.43 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  31.5 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  31.55 
 
 		 647 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  30.95 
 
 		 644 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  33.5 
 
 		 656 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  31.01 
 
 		 400 aa  156  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  31.95 
 
 		 671 aa  156  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  29.81 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 		 402 aa  153  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  30.12 
 
 		 402 aa  153  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 		 401 aa  153  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  30.12 
 
 		 409 aa  152  8e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  29.75 
 
 		 456 aa  152  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2147  hypothetical protein  33.96 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0010107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  31.76 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  32.37 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  31.13 
 
 		 652 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  31.5 
 
 		 653 aa  152  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  32.13 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.29 
 
 		 656 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  30.32 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  31.29 
 
 		 656 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  31.94 
 
 		 658 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  30.35 
 
 		 643 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  30.4 
 
 		 653 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  31.06 
 
 		 394 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 		 397 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  29.93 
 
 		 402 aa  149  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  32.37 
 
 		 409 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  31.38 
 
 		 667 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  31.38 
 
 		 667 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  31.15 
 
 		 682 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  31.12 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  31.15 
 
 		 682 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  31.52 
 
 		 407 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  30.92 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  33 
 
 		 654 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  32.11 
 
 		 651 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  31.08 
 
 		 652 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  34.62 
 
 		 654 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.05 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  32.54 
 
 		 654 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  32.38 
 
 		 398 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.44 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  29.71 
 
 		 412 aa  146  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  30.17 
 
 		 668 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  29.58 
 
 		 402 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  31.18 
 
 		 656 aa  145  9e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  30.02 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.73 
 
 		 648 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  30.97 
 
 		 648 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  30.97 
 
 		 648 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.97 
 
 		 648 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.97 
 
 		 648 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  30.97 
 
 		 648 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.97 
 
 		 648 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  30.79 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  30.79 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  31.31 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.73 
 
 		 648 aa  143  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  30.94 
 
 		 410 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  31.41 
 
 		 409 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  31.41 
 
 		 409 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  29.81 
 
 		 397 aa  142  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  30.21 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.73 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  28.64 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  29.91 
 
 		 657 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  29.8 
 
 		 668 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  29.8 
 
 		 668 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  30.6 
 
 		 648 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  27.9 
 
 		 411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  30.1 
 
 		 648 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>