More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0958 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  100 
 
 		 303 aa  626  1e-178  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  39.37 
 
 		 750 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  38.38 
 
 		 777 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  38.39 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  41.83 
 
 		 798 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  41.83 
 
 		 796 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  40.87 
 
 		 803 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  34.55 
 
 		 767 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  40.87 
 
 		 803 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  40.87 
 
 		 803 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  37.08 
 
 		 667 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  39.42 
 
 		 804 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  37.82 
 
 		 753 aa  133  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  34.78 
 
 		 813 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  36.89 
 
 		 748 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  37.25 
 
 		 707 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  35.71 
 
 		 852 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  38.14 
 
 		 751 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  41.71 
 
 		 771 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  38.56 
 
 		 728 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  35.19 
 
 		 741 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  37.71 
 
 		 728 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  31.51 
 
 		 728 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  37.55 
 
 		 727 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  38.46 
 
 		 728 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  34.5 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  34.88 
 
 		 733 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  40.76 
 
 		 764 aa  126  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  37.68 
 
 		 714 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  34.98 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  34.98 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  38.28 
 
 		 933 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  38.28 
 
 		 930 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  38.28 
 
 		 920 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  38.28 
 
 		 945 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  35.11 
 
 		 263 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  34.98 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  35.68 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  34.78 
 
 		 737 aa  122  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  31.98 
 
 		 272 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  39.63 
 
 		 776 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  35.14 
 
 		 263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  35.32 
 
 		 754 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  36.2 
 
 		 790 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  35.14 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  34.5 
 
 		 738 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  35.65 
 
 		 735 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  33.04 
 
 		 734 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  33.78 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  33.78 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  38.69 
 
 		 728 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  34.78 
 
 		 738 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  34.78 
 
 		 738 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  35.22 
 
 		 739 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  33.33 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  33.33 
 
 		 263 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  33.33 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  33.33 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  33.33 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  34.78 
 
 		 738 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  34.78 
 
 		 736 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  36.06 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  37.69 
 
 		 728 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  31.3 
 
 		 735 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  38.05 
 
 		 760 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  33.77 
 
 		 737 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  34.5 
 
 		 737 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  33.77 
 
 		 738 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  33.77 
 
 		 738 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  33.77 
 
 		 738 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  33.45 
 
 		 740 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  32.51 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  33.19 
 
 		 751 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  35.02 
 
 		 745 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.88 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  33.77 
 
 		 733 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  32.43 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  32.41 
 
 		 740 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  36.55 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  34.5 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  27.82 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  31.74 
 
 		 720 aa  109  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  32.74 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1907  patatin  34.34 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331125  hitchhiker  0.00000758802 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  33.84 
 
 		 348 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  34 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  32.8 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  34.34 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  34.87 
 
 		 335 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  31.39 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  32.83 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3633  hypothetical protein  35.2 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43300  hypothetical protein  35.2 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.882188  normal  0.835077 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  32.5 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  32 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  32.99 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  34.65 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  34.85 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  33.84 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.28 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>