More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11576 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  100 
 
 
341 aa  697    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  49.35 
 
 
659 aa  305  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  49.53 
 
 
661 aa  305  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  47.32 
 
 
665 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  43.47 
 
 
665 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  44.24 
 
 
668 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.59 
 
 
295 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 
292 aa  263  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  44.72 
 
 
664 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  45.36 
 
 
295 aa  256  3e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  46.08 
 
 
671 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  46.64 
 
 
637 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  40.53 
 
 
671 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.79 
 
 
305 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  41.84 
 
 
650 aa  231  9e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  44.85 
 
 
642 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  44.67 
 
 
701 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  44.72 
 
 
653 aa  225  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 
294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  46.15 
 
 
319 aa  215  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  44.66 
 
 
291 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  44.66 
 
 
291 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  44.66 
 
 
291 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  45.77 
 
 
294 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 
291 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 
291 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  40.74 
 
 
291 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
273 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  40.21 
 
 
294 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
290 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  33.73 
 
 
301 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
264 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  36.57 
 
 
242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
269 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  36.57 
 
 
242 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
269 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 
346 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
317 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.41 
 
 
264 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.17 
 
 
238 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.08 
 
 
264 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
258 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  30.08 
 
 
264 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
244 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.76 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.76 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.76 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.76 
 
 
264 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
240 aa  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
264 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
266 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
249 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.7 
 
 
264 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 
240 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
259 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
278 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
339 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
253 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
267 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229091  hitchhiker  0.0024535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
244 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
366 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 
291 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0300911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 
336 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
241 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
335 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
244 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.76 
 
 
242 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.76 
 
 
242 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.76 
 
 
242 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.76 
 
 
242 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.76 
 
 
242 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
266 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
279 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
347 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 
239 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
265 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
267 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 
239 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
247 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 
239 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
245 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 
239 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 
239 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 
344 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
245 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 
239 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
355 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
272 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3351  short chain dehydrogenase  33.93 
 
 
242 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
254 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.11 
 
 
248 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
257 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 
257 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 
255 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>