96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2615 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  217  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  56.67 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  54.44 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  53.19 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  56.04 
 
 		 98 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  55.95 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  56.18 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  52.22 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  49.02 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  47.96 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  47.47 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  47.47 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  43.14 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  44.94 
 
 		 109 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  45.05 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  42.57 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  42.22 
 
 		 112 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  42.22 
 
 		 112 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  46.67 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  43.62 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  41.18 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  35.71 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  51.61 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  41.38 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  39.77 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  44.12 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  71.88 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  35.58 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  38.27 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  34.15 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  32.61 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  31.58 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  31.52 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  31.52 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  33.02 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  27.59 
 
 		 270 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  40.4 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  31.25 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  35.9 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  35.9 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  48.94 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  34.41 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  35.29 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  35.48 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  25.51 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  32.93 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  32.18 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  32.97 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  35.42 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  38.1 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.99 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  36.76 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  32.14 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  27.45 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  26.74 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  35.9 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  33.73 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  34.48 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  30.21 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 100 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  29.55 
 
 		 102 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  28.09 
 
 		 104 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  25.93 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  28.41 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  31.03 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  27.18 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  28.09 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  30.1 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  35.21 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.29 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  27.18 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1854  nucleotidyltransferase family protein  33.33 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  32.86 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  34.04 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  28.57 
 
 		 109 aa  40  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>