More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0090 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
327 aa  664  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  57.36 
 
 
329 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  56.44 
 
 
328 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  55.83 
 
 
333 aa  378  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  55.83 
 
 
333 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2238  transcriptional regulator, GntR family  56.27 
 
 
331 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1216  GntR family transcriptional regulator  55.05 
 
 
329 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  56.4 
 
 
328 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20911  putative transcriptional regulator  55.18 
 
 
329 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.605524  normal  0.66693 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  52.28 
 
 
328 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3734  GntR family transcriptional regulator  55.21 
 
 
327 aa  359  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00205415  normal  0.192396 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  53.52 
 
 
328 aa  358  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3826  transcriptional regulator, GntR family  55.21 
 
 
329 aa  357  2e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3775  transcriptional regulator, GntR family  55.21 
 
 
329 aa  357  2e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  51.53 
 
 
328 aa  355  5e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2504  GntR family transcriptional regulator  54.13 
 
 
327 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  50 
 
 
328 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1082  transcriptional regulator, GntR family  51.22 
 
 
325 aa  319  4e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
321 aa  80.9  3e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
475 aa  75.5  1e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
304 aa  68.2  2e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 
129 aa  67.4  3e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 
128 aa  67.8  3e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  35.9 
 
 
156 aa  66.2  6e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
127 aa  65.9  1e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
477 aa  64.3  2e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 
131 aa  63.2  7e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  40.24 
 
 
120 aa  62.8  7e-09  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 
146 aa  62.4  1e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 
126 aa  62.4  1e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 
159 aa  62.4  1e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 
126 aa  61.2  2e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 
125 aa  60.5  4e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  46.88 
 
 
263 aa  60.5  4e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3319  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  37.21 
 
 
470 aa  60.5  4e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.823033  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  24.17 
 
 
520 aa  60.5  4e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  24.71 
 
 
321 aa  60.1  5e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 
120 aa  60.1  5e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
126 aa  58.5  1e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  43.75 
 
 
257 aa  58.2  2e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
130 aa  57.4  3e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 
254 aa  57.8  3e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.08 
 
 
501 aa  57.4  3e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4836  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
459 aa  57  4e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539292  normal  0.780725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 
129 aa  57  4e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
130 aa  56.6  5e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
496 aa  57  5e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2733  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
460 aa  56.2  6e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
127 aa  56.6  6e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 
128 aa  56.6  6e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
129 aa  56.6  6e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 
132 aa  56.6  6e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 
123 aa  56.6  6e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
501 aa  56.2  7e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 
133 aa  56.2  8e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
119 aa  55.8  9e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0251  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
467 aa  55.8  9e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 
242 aa  55.5  1e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
480 aa  55.8  1e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.92 
 
 
468 aa  55.5  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 
126 aa  55.1  2e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 
137 aa  54.7  2e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4705  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.73 
 
 
472 aa  54.7  2e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798058 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  35.38 
 
 
233 aa  55.1  2e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2948  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
460 aa  55.1  2e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216869  normal  0.403502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 
119 aa  54.7  2e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3628  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.73 
 
 
472 aa  54.7  2e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
121 aa  54.3  3e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.67 
 
 
515 aa  54.3  3e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  25.68 
 
 
305 aa  53.9  3e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
129 aa  54.3  3e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  6.97536e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.86 
 
 
485 aa  53.9  3e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
124 aa  53.9  3e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
124 aa  54.3  3e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
513 aa  53.9  3e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
121 aa  54.3  3e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1846  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.64 
 
 
473 aa  54.3  3e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.86 
 
 
485 aa  53.9  3e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
115 aa  54.3  3e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  38.67 
 
 
509 aa  53.5  4e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6494  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
482 aa  53.9  4e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 
215 aa  53.9  4e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
288 aa  53.5  4e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 
259 aa  53.5  5e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
133 aa  53.5  5e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
126 aa  53.5  5e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
133 aa  53.5  5e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  40 
 
 
502 aa  53.5  5e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 
131 aa  53.5  5e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.86 
 
 
495 aa  53.5  5e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 
123 aa  53.5  5e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
503 aa  53.5  5e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
502 aa  53.5  5e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
502 aa  53.1  6e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  31.08 
 
 
239 aa  53.1  6e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  40 
 
 
502 aa  53.1  6e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  40 
 
 
503 aa  53.1  6e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
239 aa  53.1  6e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 
134 aa  53.1  6e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
215 aa  53.1  6e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>