More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1082 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1082  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 325 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2238  transcriptional regulator, GntR family  55.02 
 
 		 331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3734  GntR family transcriptional regulator  55.02 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00205415  normal  0.192396 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 328 aa  341  9e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3826  transcriptional regulator, GntR family  52.98 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3775  transcriptional regulator, GntR family  52.98 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2504  GntR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 328 aa  309  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  48.18 
 
 		 329 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  45.4 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  44.79 
 
 		 328 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  46.01 
 
 		 328 aa  295  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20911  putative transcriptional regulator  46.48 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.605524  normal  0.66693 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1216  GntR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 329 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  44.48 
 
 		 328 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 475 aa  72.4  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 128 aa  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  26.67 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.54 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  30.4 
 
 		 126 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  27.07 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.28 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  27.07 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.89 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 501 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  32.71 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 		 128 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3330  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1215  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.77 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35.53 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.74 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35.53 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35.53 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3130  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.44 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  44.62 
 
 		 509 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0251  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 467 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2114  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 489 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.213451 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40 
 
 		 468 aa  57  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 491 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 498 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  44.62 
 
 		 504 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.62 
 
 		 507 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.1 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 503 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 502 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.54 
 
 		 501 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 501 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4096  GntR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2343  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 512 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  26.22 
 
 		 508 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0860  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 484 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 117 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 132 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 503 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1157  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 484 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1949  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 484 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1317  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 484 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.231093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5687  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 486 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 507 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1004  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 484 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.315502  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0288  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 484 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 467 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1166  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 484 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>