More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_20911 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1216  GntR family transcriptional regulator  93.31 
 
 		 329 aa  635    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20911  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 329 aa  673    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.605524  normal  0.66693 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  82.67 
 
 		 328 aa  581  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  82.01 
 
 		 329 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  80.73 
 
 		 333 aa  560  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  80.12 
 
 		 333 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  69.82 
 
 		 328 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  69.51 
 
 		 328 aa  487  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  68.9 
 
 		 328 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  66.57 
 
 		 328 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  55.18 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2238  transcriptional regulator, GntR family  49.54 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3734  GntR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00205415  normal  0.192396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2504  GntR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3775  transcriptional regulator, GntR family  47.48 
 
 		 329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3826  transcriptional regulator, GntR family  47.48 
 
 		 329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1082  transcriptional regulator, GntR family  46.48 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 475 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  31.01 
 
 		 126 aa  68.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  37.38 
 
 		 127 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  25.76 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 128 aa  67  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 321 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  22.96 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.71 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  27.78 
 
 		 126 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  27.78 
 
 		 126 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.48 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 125 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 120 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09150  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87157 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.64 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.68 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.79 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.48 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 121 aa  58.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.02 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.02 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  41.56 
 
 		 509 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  32.1 
 
 		 484 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 121 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  28.57 
 
 		 122 aa  57  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 564 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 546 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 564 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 564 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 562 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 561 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 564 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.74 
 
 		 485 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  40 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.74 
 
 		 485 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 488 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 496 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0251  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 473 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.27 
 
 		 515 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 132 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.68 
 
 		 490 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 477 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 241 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 480 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35.53 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 		 125 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 490 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 513 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3130  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467751  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.01 
 
 		 494 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35.53 
 
 		 483 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35.53 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>