More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2199 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  26.21 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  46.05 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  46.05 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20911  putative transcriptional regulator  43.42 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.605524  normal  0.66693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2504  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2238  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1216  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  44.74 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  40.4 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3826  transcriptional regulator, GntR family  40.45 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1082  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3775  transcriptional regulator, GntR family  40.45 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.8 
 
 		 495 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  44.74 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  47.44 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 125 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3734  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00205415  normal  0.192396 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.43 
 
 		 501 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09150  transcriptional regulator, GntR family  43.21 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  39.81 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.06 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 124 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.74 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.86 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6026  GntR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  34.82 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 121 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1604  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  33.88 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 506 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 506 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 506 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 509 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 506 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 506 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 506 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 488 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 473 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 126 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.25 
 
 		 490 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4189  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 124 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 122 aa  61.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5991  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.21 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.6 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 117 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.78 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.78 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  30.7 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.67 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  30.7 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0780  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 494 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3468  GntR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00974022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  34.26 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 502 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 502 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>