More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0707 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 254 aa  475  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  46.91 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09150  transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87157 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 121 aa  67  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.44 
 
 		 453 aa  65.9  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.44 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3130  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467751  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  41.9 
 
 		 125 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  37.96 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 509 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  43.24 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  42.53 
 
 		 503 aa  62  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 248 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  35.8 
 
 		 470 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 120 aa  62  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1672  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  42.5 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1267  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2758  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797611 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 132 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  42.11 
 
 		 126 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  41.77 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 547 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3468  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00974022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  40.43 
 
 		 118 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 129 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  41.77 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  40.54 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  41.89 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 546 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.46 
 
 		 515 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 564 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 564 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 561 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.08 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 564 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 564 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 562 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 477 aa  59.7  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  44.59 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 495 aa  59.7  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 475 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4344  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 476 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266344  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 498 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 509 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 501 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1604  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.67 
 
 		 494 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 		 482 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  40.95 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 480 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 477 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  38.79 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.76 
 
 		 514 aa  58.5  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44 
 
 		 593 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  41.79 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 115 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2238  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 116 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>