More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0083 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  97.6 
 
 
333 aa  666    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
333 aa  677    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  94.17 
 
 
329 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  85.58 
 
 
328 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1216  GntR family transcriptional regulator  81.65 
 
 
329 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20911  putative transcriptional regulator  80.73 
 
 
329 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.605524  normal  0.66693 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  71.17 
 
 
328 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  70.86 
 
 
328 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  69.63 
 
 
328 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  69.02 
 
 
328 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  55.83 
 
 
327 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2238  transcriptional regulator, GntR family  48.17 
 
 
331 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2504  GntR family transcriptional regulator  48.77 
 
 
327 aa  323  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  48.33 
 
 
328 aa  316  4e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3734  GntR family transcriptional regulator  46.04 
 
 
327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00205415  normal  0.192396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1082  transcriptional regulator, GntR family  48.18 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3826  transcriptional regulator, GntR family  46.39 
 
 
329 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3775  transcriptional regulator, GntR family  46.39 
 
 
329 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
475 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  34.62 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
127 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  25 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 
159 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 
128 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 
126 aa  63.9  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  28.12 
 
 
126 aa  63.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
480 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  29.84 
 
 
122 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09150  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 
454 aa  60.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87157 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.13 
 
 
468 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  37.35 
 
 
503 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
496 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
502 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  38.46 
 
 
502 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
502 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
490 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.45 
 
 
494 aa  59.3  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.03 
 
 
501 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.3 
 
 
495 aa  59.3  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 
137 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
501 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
129 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.24 
 
 
504 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 
146 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
546 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
564 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
564 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
562 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
564 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 
120 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.24 
 
 
507 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  41.03 
 
 
564 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  41.03 
 
 
561 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
502 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  41.56 
 
 
509 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  41.89 
 
 
502 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
477 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
503 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
122 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
473 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.2 
 
 
501 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  43.1 
 
 
484 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.75 
 
 
515 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
473 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
478 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
478 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 
305 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
121 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
512 aa  56.6  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1604  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.49 
 
 
494 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
121 aa  56.2  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
133 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
133 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40 
 
 
485 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 
133 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  40.54 
 
 
520 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 
126 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3319  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  43.08 
 
 
470 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.823033  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  34.18 
 
 
126 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.83 
 
 
444 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40 
 
 
485 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 
125 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  34.18 
 
 
126 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.87 
 
 
490 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 
120 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  40.54 
 
 
488 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.78 
 
 
514 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 
513 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1335  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
459 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  38.46 
 
 
467 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3130  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3848  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 
506 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 
132 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  36.23 
 
 
233 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  38.46 
 
 
121 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 
259 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>