More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1250 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1250  ATPase  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1219  ATPase  84.38 
 
 
225 aa  357  8e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0615432  normal  0.958487 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07861  ABC transporter, ATP-binding component  73.21 
 
 
230 aa  342  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0716769  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0154  ABC transporter ATP-binding protein  73.21 
 
 
230 aa  341  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16611  ABC transporter, ATP-binding component  76.23 
 
 
229 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10131  ABC transporter, ATP-binding component  72.69 
 
 
251 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0945741 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08341  ABC transporter, ATP-binding component  68.89 
 
 
237 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.119889  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08111  ABC transporter, ATP-binding component  67.86 
 
 
242 aa  312  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08101  ABC transporter, ATP-binding component  67.86 
 
 
242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0758  ABC transporter ATP-binding protein  67.26 
 
 
242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  58.37 
 
 
225 aa  275  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  60.79 
 
 
237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  56.5 
 
 
237 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  56.5 
 
 
237 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0332  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  57.92 
 
 
241 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  53.3 
 
 
250 aa  254  9e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4444  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  56.11 
 
 
231 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  54.31 
 
 
242 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0008  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  56.11 
 
 
232 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  53.07 
 
 
237 aa  249  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  54.34 
 
 
244 aa  248  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  53.39 
 
 
242 aa  246  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  55.2 
 
 
453 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  52.23 
 
 
231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0599  ABC transporter-like  52.28 
 
 
246 aa  227  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  49.09 
 
 
408 aa  214  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  49.77 
 
 
227 aa  209  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  48.83 
 
 
217 aa  192  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  46.28 
 
 
255 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  50 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  51.22 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  44.64 
 
 
259 aa  185  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  44.09 
 
 
242 aa  174  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  43.61 
 
 
252 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44.21 
 
 
277 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  45.74 
 
 
233 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  38.22 
 
 
233 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  42.73 
 
 
230 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  40.79 
 
 
244 aa  168  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.01 
 
 
239 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  38.53 
 
 
233 aa  166  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  41.74 
 
 
241 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  36.82 
 
 
228 aa  164  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 
345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  42.73 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  41.18 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  36.61 
 
 
604 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  41.89 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  40.38 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  43.18 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
223 aa  161  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  43.12 
 
 
230 aa  161  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  41.44 
 
 
563 aa  161  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
223 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  39.37 
 
 
223 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
223 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  39.37 
 
 
223 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  41.59 
 
 
231 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  44.14 
 
 
235 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  44.59 
 
 
235 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  41.07 
 
 
240 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  43.05 
 
 
246 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
223 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 
228 aa  159  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  38.91 
 
 
223 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  40.27 
 
 
246 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 
236 aa  159  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  42.36 
 
 
254 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  40.38 
 
 
241 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  41.31 
 
 
240 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2588  ABC transporter related  43.46 
 
 
247 aa  159  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0206492  hitchhiker  0.00398644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  41.82 
 
 
237 aa  158  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  39.91 
 
 
241 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1409  ABC transporter related  44.35 
 
 
242 aa  158  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.773805  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
234 aa  158  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  37.73 
 
 
237 aa  157  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.91 
 
 
234 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  39.07 
 
 
221 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  43.11 
 
 
231 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  38.68 
 
 
249 aa  156  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  41.85 
 
 
234 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  39.91 
 
 
229 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  37.12 
 
 
237 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  41.07 
 
 
234 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  38.67 
 
 
233 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4324  ABC transporter-related protein  45.58 
 
 
248 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  43.3 
 
 
277 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0967  ABC transporter related  45.91 
 
 
261 aa  155  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.205736  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  40.18 
 
 
232 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  39.64 
 
 
565 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  41.26 
 
 
286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  41.26 
 
 
230 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  41.2 
 
 
235 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 
229 aa  154  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  39.29 
 
 
237 aa  154  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  37.61 
 
 
235 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  37.84 
 
 
223 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>